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J-GLOBAL ID：201702239471413480   整理番号：17A1434670

B型肝炎ウイルスの全ゲノムハイスループット解析の使用により同定された肝細胞癌関連一塩基変異と欠失【Powered by NICT】

Hepatocellular carcinoma-associated single-nucleotide variants and deletions identified by the use of genome-wide high-throughput analysis of hepatitis B virus

著者 (29件)： Liu Wen-Chun (Department of Internal Medicine, National Cheng Kung University Hospital, College of Medicine, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Liu Wen-Chun (Infectious Disease and Signalling Research Centre, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Wu I-Chin (Department of Internal Medicine, National Cheng Kung University Hospital, College of Medicine, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Wu I-Chin (Infectious Disease and Signalling Research Centre, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Lee Yen-Chien (Department of Oncology, Tainan Hospital, Ministry of Health and Welfare, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Lee Yen-Chien (Institute of Clinical Medicine, College of Medicine, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Lin Chih-Peng (Yourgene Bioscience, Taipei, Taiwan, ROC) ,  Cheng Ji-Hong (Department of Computer Science and Information Engineering, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Lin Yih-Jyh (Department of Surgery, National Cheng Kung University College of Medicine and Hospital, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Yen Chia-Jui (Department of Internal Medicine, National Cheng Kung University Hospital, College of Medicine, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Yen Chia-Jui (Infectious Disease and Signalling Research Centre, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Cheng Pin-Nan (Department of Internal Medicine, National Cheng Kung University Hospital, College of Medicine, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Cheng Pin-Nan (Infectious Disease and Signalling Research Centre, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Li Pei-Fu (Institute of Medical Informatics, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Cheng Yi-Ting (Institute of Medical Informatics, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Cheng Pei-Wen (Department of Information and Learning Technology, Science and Engineering College, National University of Tainan, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Sun Koun-Tem (Department of Information and Learning Technology, Science and Engineering College, National University of Tainan, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Yan Shu-Ling (Department of Internal Medicine, National Cheng Kung University Hospital, College of Medicine, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Lin Jia-Jhen (Department of Internal Medicine, National Cheng Kung University Hospital, College of Medicine, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Yang Jui-Chu (Human Biobank, Research Centre of Clinical Medicine, National Cheng Kung University Hospital, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Chang Kung-Chao (Human Biobank, Research Centre of Clinical Medicine, National Cheng Kung University Hospital, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Ho Cheng-Hsun (Department of Internal Medicine, National Cheng Kung University Hospital, College of Medicine, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Ho Cheng-Hsun (Infectious Disease and Signalling Research Centre, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Tseng Vincent S (Department of Computer Science, National Chiao Tung University, Hsinchu, Taiwan, ROC) ,  Chang Bill Chia-Han (Yourgene Bioscience, Taipei, Taiwan, ROC) ,  Wu Jaw-Ching (Institute of Clinical Medicine, School of Medicine, National Yang-Ming University, Taipei, Taiwan, ROC) ,  Wu Jaw-Ching (Translational Research Division, Medical Research Department, Taipei Veterans General Hospital, Taipei, Taiwan, ROC) ,  Chang Ting-Tsung (Department of Internal Medicine, National Cheng Kung University Hospital, College of Medicine, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC) ,  Chang Ting-Tsung (Infectious Disease and Signalling Research Centre, National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan, ROC)
資料名： Journal of Pathology  (Journal of Pathology)
巻： 243  号： 2  ページ： 176-192  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0171A  ISSN： 0022-3417  CODEN： JPTLA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,B型肝炎ウイルス(HBV)単一ヌクレオチド変異体(SNV)と肝細胞癌(HCC)と関連した欠失変異を検討した。九十三人のHCC患者と108名のHCC患者はHBVゲノムワイド次世代シークエンシング(NGS)解析に登録した。系統的文献レビューとメタアナリシスはNGS定義H CC関連SNVsと欠失を検証するために行った。実験結果は,60NGS定義H CC関連SNV,41種類の新しいSNVを含むそれらの病原性周波数を同定した。各SNVは,遺伝子型B(n=24)または遺伝子型C(n=34)のどちらかに特異的な,nt53C,両遺伝子型で存在していた。これらH CC関連SNVsの病原性周波数は明確なU字型分布パターンを示した。メタ分析と文献レビューによると,109種類の文献における167HBV変異体は肝細胞癌と関連していることを支持する証拠の四レベル(A D)に分類した。これらHBV変異体間のNGS定義H CC関連SNVsの割合は,メタ分析(レベルD)(P<0.0001)によるメタ分析(レベルA)による12H CC関連変異体の75%から有意に減少した10HCC非会合変異体の0%であった。PreSの欠失は有意にHCCと関連した欠失率の観点から,両遺伝子型のB(P=0.030)およびC(P=0.049)であった。遺伝子型Cは,特異的断片(nt2977 3013)を含むプレS欠失は有意に肝細胞癌(HCCと非HCC,6/34対0/32,P=0.025)と関連していた。プレS欠失のメタ分析は,HCC(要約オッズ比3.0;95%信頼区間2.3 3.9)と有意な相関を示した。Huh7細胞へのトランスフェクションは,マイクロアレイ,リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応とウェスタンブロット分析によって示されるように,小胞体ストレスとDNA修復システムを含む,小さな表面領域における五種類の新規NGS定義H CC関連SNVsの全てが肝発癌経路に影響することを示した。その発癌機構は更なる研究の価値がある。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *変異 ,  小胞体ストレス ,  DNA修復 ,  *B型肝炎ウイルス ,  リアルタイムPCR法 ,  遺伝子型 ,  欠失突然変異 ,  メタ分析 ,  *肝細胞癌 ,  ウェスタンブロット法 ,  文献展望 ,  患者 ,  トランスフェクション ,  病原性
準シソーラス用語： マイクロアレイ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 欠失指数 ,  肝発癌 ,  メタ分析 ,  次世代配列決定 ,  U字型分布

分類 (1件)： 消化器の腫よう  (GH04000D)

タイトルに関連する用語 (9件)： B型肝炎ウイルス ,  ゲノム ,  ハイスループット ,  解析 ,  同定 ,  肝細胞癌 ,  塩基 ,  変異 ,  欠失