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J-GLOBAL ID：201702239506723015   整理番号：17A1284180

リンゴDREB転写因子ファミリーの全ゲノム同定と解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide Identification and Analysis of the DREB Transcription Factor Gene Family in Apple

著者 (8件)： Chen Bingqi (西南林業大学 云南省高校林木遺伝改良与繁育重点実験室,昆明 650224;西南林業大学 西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点実験室,昆明 650224) ,  Gao Xiaoyu (西南林業大学 云南省高校林木遺伝改良与繁育重点実験室,昆明 650224;西南林業大学 西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点実験室,昆明 650224) ,  Wang Dawei (西南林業大学 云南省高校林木遺伝改良与繁育重点実験室,昆明 650224;西南林業大学 西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点実験室,昆明 650224) ,  Zhou Jun (西南林業大学 云南省高校林木遺伝改良与繁育重点実験室,昆明 650224;西南林業大学 西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点実験室,昆明 650224) ,  Deng Lang (西南林業大学 云南省高校林木遺伝改良与繁育重点実験室,昆明 650224;西南林業大学 西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点実験室,昆明 650224) ,  Zhou Fan (西南林業大学 云南省高校林木遺伝改良与繁育重点実験室,昆明 650224;西南林業大学 西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点実験室,昆明 650224) ,  Ji Qing (西南林業大学 云南省高校林木遺伝改良与繁育重点実験室,昆明 650224;西南林業大学 西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点実験室,昆明 650224) ,  Cheng Hui (西南林業大学 云南省高校林木遺伝改良与繁育重点実験室,昆明 650224;西南林業大学 西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点実験室,昆明 650224)
資料名： Xibei Zhiwu Xuebao  (Xibei Zhiwu Xuebao)
巻： 37  号： 3  ページ： 460-469  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2196A  ISSN： 1000-4025  CODEN： XZXUEV  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： DREB転写因子がAP2/ERF転写因子ファミリーに属し、DRE/CRTシス作用エレメントと特異的に結合し、ストレス応答遺伝子の発現を調節できるため、植物は低温、干ばつ、高塩分などのストレスストレスにおいて重要な役割を果たす。本研究では、リンゴの全ゲノムデータを利用し、生物情報学的手段によりリンゴDREB転写因子ファミリーのメンバーを同定し、DREB転写因子ファミリーの保存ドメインの特徴と機能及び発現状況を分析した。結果は以下を示した。リンゴの全ゲノムから60個のDREB転写因子ファミリーのメンバーを同定し、シロイヌナズナと水稲と比べて、基本的に一致し、シロイヌナズナDREB遺伝子を導入することによって系統発生分析を行い、さらにそれを6つのサブグループに分けることができる。構造ドメインと保存要素の分析により、DREB遺伝子ファミリーはAP2保存ドメインを含むことが明らかになった。染色体の位置決めにより、リンゴDREB遺伝子は11本の染色体に分布し、一部の遺伝子は直列の複製現象が存在することが明らかになった。遺伝子構造分析により、このサブファミリー遺伝子はイントロンを含まないことが示された。相同性シロイヌナズナのRNA-Seqデータの分析結果により、DREB転写因子ファミリーは低温、ABA調節などの非生物ストレスに対して調節作用があり、同時にDREBサブファミリーにおいて、各サブグループは異なる非生物ストレスに応答することが明らかになった。DREB遺伝子の異なる組織における発現情況を分析することにより、DREB遺伝子の植物根部における発現量が最も強く、その次が葉であることを示した。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： Arabidopsis thaliana ,  *転写因子 ,  低温 ,  イントロン ,  干ばつ ,  相同性 ,  遺伝子 ,  RNA【核酸】
準シソーラス用語： 非生物的ストレス ,  遺伝子構造 ,  遺伝子ファミリー ,  系統解析 ,  バイオインフォマティクス ,  ストレス応答遺伝子 ,  AP2因子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： apple ,  DREB ,  transcription factor ,  bioinformatics ,  homologous expression

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： リンゴ ,  転写因子 ,  ファミリー ,  ゲノム ,  同定 ,  解析