文献

J-GLOBAL ID：201702240154866124   整理番号：17A1029321

RNA可視化:シュードノットとの関連性と現在の最先端集束【Powered by NICT】

RNA Visualization: Relevance and the Current State-of-the-Art Focusing on Pseudoknots

著者 (2件)： Shabash Boris (School of Computing Science, Simon Fraser University, Burnaby, BC) ,  Wiese Kay C. (School of Computing Science, Simon Fraser University, Burnaby, BC)
資料名： IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics  (IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics)
巻： 14  号： 3  ページ： 696-712  発行年： 2017年 
JST資料番号： W1409A  ISSN： 1545-5963  CODEN： ITCBCY  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNA構造とその機能,ならびにより良い球RNA構造予測アルゴリズムの開発の間に存在する関係を理解するためにRNA可視化が重要である。しかし,RNA可視化との関連で,1つの重要な構造は可視化することは困難である:シュードノット。二つの二次構造要素はそれらの間の塩基対を形成するシュードノットは,RNA折畳みであった。これらの成分の三次元的性質は,二次元媒質中の可視化に挑戦し,印刷媒体またはスクリーンなど。本レビューでは,過去二年間における二次元媒質におけるRNA可視化の分野でなされた進歩に焦点を当てた。レビューはシュードノットの可視化のすべての適切な特徴を示すことを目的とする。いくつかのシュードノット構造の概要とRNA機能におけるそれらの関連性から始めた。次に,RNA構造トポロジー分類のための理論的基礎を論じ,シュードノットおよび非シュードノット両RNAのためのRNA分類システムを提案した。RNA分類システムの各記述はRNAを可視化するために,異なるツールの長所と欠点を比較するために開発されたソフトウェアツールとアルゴリズムの検討を行った。Copyright 2017 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 三次元 ,  集束 ,  スクリーン ,  二次構造 ,  *RNA【核酸】 ,  二次元 ,  位相幾何学 ,  塩基対 ,  *可視化 ,  媒質 ,  支援プログラム ,  アルゴリズム
準シソーラス用語： 予測アルゴリズム ,  RNA構造 ,  *シュードノット , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： RNA ,  可視化 ,  シュードノット ,  関連性 ,  最先端 ,  集束