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J-GLOBAL ID：201702240234065285   整理番号：17A0109512

遺伝子 33遺伝子の組几丁質Mei遺伝子ファミリーを,遺伝子ゲノムマイニングによって分析した。【JST・京大機械翻訳】

Genome Mining for Chitinase and Chitinase-like Gene Family in Brevibacillus brevis GZDF3

著者 (7件)： Liu Hongmei (School of Biology and Engineering, Guizhou Medical University) ,  Li Yuquan (School of Biology and Engineering, Guizhou Medical University) ,  Tao Xiaomai (School of Biology and Engineering, Guizhou Medical University) ,  Zhao Jianli (School of Biology and Engineering, Guizhou Medical University) ,  Zhou Jing (School of Biology and Engineering, Guizhou Medical University) ,  Zhang Tingting (School of Biology and Engineering, Guizhou Medical University) ,  Ye Yuannong (School of Biology and Engineering, Guizhou Medical University)
資料名： Jiyinzuxue Yuyingyong Shengwu Xue  (Jiyinzuxue Yuyingyong Shengwu Xue)
巻： 35  号： 9  ページ： 2390-2397  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2933A  ISSN： 1674-568X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究の目的は,全 33株におけるキチナーゼ遺伝子ファミリーを分析することである。まず第一に,BIOEDITソフトウェアを用いて短い 33の全ゲノムデータベースにおけるキチナーゼ遺伝子ファミリーを探索し,次に,オンラインのアミノ酸組成,物理化学的性質,シグナルペプチド,疎水性,および二次構造をオンライン分析とソフトウェアによって予測した。そして,系統樹を構築した。結果は,6つのキチナーゼ遺伝子が6つの異なる構造タイプのキチナーゼをコードすることを示した。6種類のキチナーゼはいずれもグリコシド結合の第18ファミリーに属している。2つのキチナーゼのN末端には,シグナルペプチド配列とシグナルペプチド部位があった。2種類のキチナーゼはアルカリ性蛋白質,4種類は酸性蛋白質,6種類は親水性蛋白質であった。本研究により、短い菌株GZDF3のゲノムに構造の多様なキチナーゼがあり、分析結果は後続の遺伝子クローニング及び機能研究に参考を提供することが分かった。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 系統樹 ,  疎水性 ,  キチナーゼ ,  *ゲノム ,  アミノ酸組成 ,  酸性 ,  遺伝子クローニング ,  *遺伝子 ,  親水性 ,  シグナルペプチド
準シソーラス用語： 菌株 ,  アルカリ性 ,  物理化学的性質 ,  ゲノムデータベース ,  *遺伝子ファミリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Chitinase ,  Brevibacillus brevis ,  Bioinformatics ,  Phylogenetic tree

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (4件)： 遺伝子 ,  遺伝子ファミリー ,  ゲノムマイニング ,  分析