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J-GLOBAL ID：201702240312196512   整理番号：17A1004443

RNASeq-er API-公共のRNA配列データの最新の系統的分析への入り口

The RNASeq-er API-a gateway to systematically updated analysis of public RNA-seq data

著者 (7件)： PETRYSZAK Robert (European Bioinformatics Inst., Hinxton, GBR) ,  FONSECA Nuno A. (European Bioinformatics Inst., Hinxton, GBR) ,  FUELLGRABE Anja (European Bioinformatics Inst., Hinxton, GBR) ,  HUERTA Laura (European Bioinformatics Inst., Hinxton, GBR) ,  KEAYS Maria (European Bioinformatics Inst., Hinxton, GBR) ,  TANG Y. Amy (European Bioinformatics Inst., Hinxton, GBR) ,  BRAZMA Alvis (European Bioinformatics Inst., Hinxton, GBR)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 14  ページ： 2218-2220  発行年： 2017年07月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 最近のRNA配列データの球速な増加とともに,単一細胞のRNA-seqに代表されるように,RNA配列検出に関する新規な技術と分析方法は完成度を高めている。本論文ではヨーロッパヌクレオチドアーカイブ(ENA)における公共的RNA-seq稼働状況が指数関数的に増大していることを示した。その中にあって主要なシーケンシング技術であるRNASeq-er API(応用プログラムインターフェイス)はオントロジーを利用する検索ソフトであるが,種々の既存のRNA配列ファイルからの検索,さらに遺伝子およびエクソン定量化マトリックス,ならびにオントロジー用語で注釈される試料属性の検索に極めて有効である。今日までにENAでは,RNASeq-er APIを用いて270,000以上のRNA-seqデータが解析され利用者に提供されている。

シソーラス用語： 遺伝学実験技術 ,  オントロジー ,  システムインタフェイス ,  ヌクレオチド配列 ,  *インタフェイス ,  *ソフトウェア ,  遺伝子 ,  エキソン
準シソーラス用語： API【計算機】 ,  *RNA-seq ,  *RNASeq-er API ,  RNA配列解析 ,  RNAシークエンシング ,  遺伝子配列決定

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： Er ,  API ,  RNA ,  系統 ,  分析 ,  入り口