文献

J-GLOBAL ID：201702240628924208   整理番号：17A1459632

膜結合ヒトオーファンチトクロームP4502U1:配列特異性,完全な3次元モデルの構築と基質ドッキング【Powered by NICT】

Membrane-bound human orphan cytochrome P450 2U1: Sequence singularities, construction of a full 3D model, and substrate docking

著者 (8件)： Ducassou Lionel (UMR 8601 CNRS, University Paris Descartes, Paris Sorbonne Cite, 75270, Paris, France) ,  Dhers Laura (UMR 8601 CNRS, University Paris Descartes, Paris Sorbonne Cite, 75270, Paris, France) ,  Jonasson Gabriella (University Paris Saclay, I2BC/CNRS UMR 9198, CEA Saclay, 91191, Gif sur Yvette, France) ,  Pietrancosta Nicolas (UMR 8601 CNRS, University Paris Descartes, Paris Sorbonne Cite, 75270, Paris, France) ,  Pietrancosta Nicolas (Team Chemistry & Biology, Modeling & Immunology for Therapy, CBMIT, 2MI Platform, France) ,  Boucher Jean-Luc (UMR 8601 CNRS, University Paris Descartes, Paris Sorbonne Cite, 75270, Paris, France) ,  Mansuy Daniel (UMR 8601 CNRS, University Paris Descartes, Paris Sorbonne Cite, 75270, Paris, France) ,  Andre Francois (University Paris Saclay, I2BC/CNRS UMR 9198, CEA Saclay, 91191, Gif sur Yvette, France)
資料名： Biochimie  (Biochimie)
巻： 140  ページ： 166-175  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0147A  ISSN： 0300-9084  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒトチトクロームP4502U1(CYP2U1)は,ほとんど全部の生物における高度に保存された配列を持つ57種のヒトCYPのいくつかの特徴的な特性を示すことがオーファンCYPである。は57種のヒトCYPとの蛋白質配列を比較し,POPC膜に結合した完全長CYP2U1モデルの3D構造を構築した。もこのモデルでアラキドン酸(AA)およびN arachidonoylserotonin(AS)のドッキング実験を行った。ヒトCYPの8プロリン残基を含む推定上の膜貫通ヘリックス(TMH)のより長いN末端領域上流の存在,及びヘリックスA′及びAの間の5アルギニン残基を含む約20アミノ酸の挿入に比べた場合,CYP2U1の蛋白質配列は,二のユニークな特性を示した。TMHのN末端部上流は付加的な短い末端ヘリックスを含み,Saccharomyces cerevisiae CYP51の結晶構造で報告されたものと類似した。著者らのモデルはまた,脂質極性ヘッドの挿入AA′とリン酸基の荷電した残基間の特異的相互作用を示し,基質動員におけるこの挿入の可能な役割を示唆した。このモデル中のAAとASのドッキングは,チャンネル2Acのこれらの基質を示し,ヘムに近いAAの末端アルキル鎖またはASのインドール環と,報告されたCYP2U1触媒AAとASヒドロキシル化位置選択性と一致した。モデルは新しい内因性または外因性CYP2U1基質を見出し,それらのヒドロキシル化の位置選択性を解釈するために有用なはずである。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 相互作用 ,  Saccharomyces cerevisiae ,  *ドッキング ,  ヒドロキシ化 ,  極性 ,  チャネル ,  タンパク質 ,  *ヒト ,  結晶構造 ,  三次元 ,  *基質 ,  触媒 ,  脂質
準シソーラス用語： 残基 ,  *特異性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 活性部位トポロジー ,  膜相互作用 ,  アクセスチャネル ,  アラキドン酸 ,  N arachidonoylserotonin ,  分子動力学

分類 (4件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  生体膜一般  (EF04010G) ,  細胞膜の輸送  (EF04020R) ,  細胞膜の受容体  (EF04030C)

タイトルに関連する用語 (8件)： 膜結合 ,  ヒト ,  ファン ,  特異性 ,  3次元モデル ,  構築 ,  基質 ,  ドッキング