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J-GLOBAL ID：201702242086676501   整理番号：17A1233331

G4プロモーターderivedアプタマー選択とin silico成熟を併用したHGF結合アプタマーの開発【Powered by NICT】

Development of HGF-binding aptamers with the combination of G4 promoter-derived aptamer selection and in silico maturation

著者 (8件)： Yokoyama Tomomi (Department of Biotechnology and Life Science, Tokyo University of Agriculture and Technology, 2-24-16 Naka-cho, Koganei, Tokyo 184-8588, Japan) ,  Tsukakoshi Kaori (Department of Biotechnology and Life Science, Tokyo University of Agriculture and Technology, 2-24-16 Naka-cho, Koganei, Tokyo 184-8588, Japan) ,  Yoshida Wataru (School of Biotechnology and Bioscience, Tokyo University of Technology, Hachioji, Tokyo, Japan) ,  Saito Taiki (Department of Biotechnology and Life Science, Tokyo University of Agriculture and Technology, 2-24-16 Naka-cho, Koganei, Tokyo 184-8588, Japan) ,  Teramoto Kentaro (Department of Biotechnology and Life Science, Tokyo University of Agriculture and Technology, 2-24-16 Naka-cho, Koganei, Tokyo 184-8588, Japan) ,  Savory Nasa (Department of Biotechnology and Life Science, Tokyo University of Agriculture and Technology, 2-24-16 Naka-cho, Koganei, Tokyo 184-8588, Japan) ,  Abe Koichi (Department of Biotechnology and Life Science, Tokyo University of Agriculture and Technology, 2-24-16 Naka-cho, Koganei, Tokyo 184-8588, Japan) ,  Ikebukuro Kazunori (Department of Biotechnology and Life Science, Tokyo University of Agriculture and Technology, 2-24-16 Naka-cho, Koganei, Tokyo 184-8588, Japan)
資料名： Biotechnology and Bioengineering  (Biotechnology and Bioengineering)
巻： 114  号： 10  ページ： 2196-2203  発行年： 2017年 
JST資料番号： D0019A  ISSN： 0006-3592  CODEN： BIBIAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 指数濃縮(SELEX)によるリガンドの系統的進化を伴わずにバイオインフォマティクス基盤のアプローチに基づくアプタマーの選択について述べた。SELEXは強力な方法である;が,時間集約的であり,PCR増幅段階,SELEXのための必須の段階である,は良好なアプタマーの消失をもたらした。アプタマースクリーニング法,G4プロモーター派生アプタマー選択(G4PAS),及びアプタマー改善法,in silico成熟(ISM)を開発した。in silico配列選択と計算機支援指向性進化に基づいているであった。本研究では,著者らはG4PASによる肝細胞成長因子(HGF)に対する新規アプタマーを同定するだけでなくISMによるHGFアプタマーの特異性を改善することに成功した。ISMを用いた元のアプタマーと比較して45倍までHGFに対するアプタマーの特異性を改善した。これらの方法は良好なアプタマーの容易で効率的な同定を可能にし,ISMとG4PASの組合せは,アプタマー同定のための強力な方法として給することができる。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： PCR法 ,  *プロモーター領域 ,  HGF【成長因子】 ,  スクリーニング ,  重鎖 ,  集中化 ,  定向進化 ,  バイオインフォマティクス ,  リガンド ,  SELEX法 ,  *in silico ,  *アプタマー
準シソーラス用語： 特異性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： アプタマー選択 ,  アプタマー改善 ,  G-四重鎖 ,  in silico ,  肝細胞成長因子

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： プロモーター ,  アプタマー ,  成熟 ,  併用 ,  HGF ,  開発