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J-GLOBAL ID：201702242249981621   整理番号：17A1177806

対組織および血しょう試料中の捕捉をベースとする標的ウルトラディープ配列決定は進行肺癌における異なるサブクローンctDNA放出能力を示す【Powered by NICT】

Capture-Based Targeted Ultradeep Sequencing in Paired Tissue and Plasma Samples Demonstrates Differential Subclonal ctDNA-Releasing Capability in Advanced Lung Cancer

著者 (10件)： Mao Xiaowei (Department of Endoscopy and Pulmonary Medicine, Shanghai Chest Hospital, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, People’s Republic of China) ,  Zhang Zhou (Burning Rock Biotech, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Zheng Xiaoxuan (Department of Endoscopy and Pulmonary Medicine, Shanghai Chest Hospital, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, People’s Republic of China) ,  Xie Fangfang (Department of Endoscopy and Pulmonary Medicine, Shanghai Chest Hospital, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, People’s Republic of China) ,  Duan Feidie (Burning Rock Biotech, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Jiang Liyan (Department of Endoscopy and Pulmonary Medicine, Shanghai Chest Hospital, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, People’s Republic of China) ,  Chuai Shannon (Burning Rock Biotech, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Han-Zhang Han (Burning Rock Biotech, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Han Baohui (Department of Endoscopy and Pulmonary Medicine, Shanghai Chest Hospital, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, People’s Republic of China) ,  Sun Jiayuan (Department of Endoscopy and Pulmonary Medicine, Shanghai Chest Hospital, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, People’s Republic of China)
資料名： Journal of Thoracic Oncology  (Journal of Thoracic Oncology)
巻： 12  号： 4  ページ： 663-672  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3145A  ISSN： 1556-0864  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 非侵襲的腫瘍遺伝的プロファイルを評価するための不偏方法を表す循環腫瘍DNA(ctDNA)は腫瘍内不均一性を研究する容易にした。腫瘍内不均一性はいくつかの癌タイプ,NSCLCを含む実質的に解明されているが,それらのDNAを放出する異なる遺伝的異常を持つ腫瘍細胞の能力にどのように影響するか不明のままである。ディープシークエンシングを用いて血漿試料からの遺伝的変化の検出と定量のための非小細胞肺癌を標的とする捕獲パネルを設計した。対生検及び血漿試料にパネルを適用することにより,明確な遺伝的変異体を持つサブクローンにおけるctDNA放出効率を帰属と比較した。進行肺癌患者からの40対の整合生検及び血漿試料を採取し,著者らのLungPlasmaパネルを用いた捕獲配列決定,168遺伝子の重要なエキソンとイントロンを適用した。ctDNA放出効率を反映する正規化相対対立遺伝子画分スコア(NRAFS)を導出した。基準として生検試料中の検出された変異を用いて,87.2%変異体感度,一塩基変異体,挿入または欠失,遺伝子融合を含むを達成した。七最も重要で実用的な遺伝子の変異体感度は96.2%であった。七実用的な遺伝子から変異を持つサブクローンの平均NRAFSは0.877であった対照的に,他の変異の平均NRAFSは0.658であった。細胞周期経路に関与する四遺伝子の変異は他の二群(p=0.07)と比較して特に低NRAFS(0.480)を有していた。ドライバー変異を有するサブクローンはDNAを放出しやすいことを示した。も捕獲配列決定の定量的能力を示し,臨床設定におけるルーチン利用への道が開かれつつある。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 腫瘍細胞 ,  遺伝 ,  細胞周期 ,  生検 ,  非小細胞肺癌 ,  *血漿 ,  対立遺伝子 ,  捕獲 ,  *DNA【核酸】 ,  変異 ,  遺伝病 ,  腫瘍 ,  患者 ,  不均一性
準シソーラス用語： *進行肺癌 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 肺癌 ,  捕獲ベース標的化配列決定 ,  ctDNA ,  液体生検 ,  放出能力

分類 (1件)： 呼吸器の腫よう  (GI04000G)

タイトルに関連する用語 (11件)： 組織 ,  血しょう ,  試料 ,  捕捉 ,  標的 ,  ディープ配列決定 ,  進行肺癌 ,  サブ ,  クローン ,  放出 ,  能力