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J-GLOBAL ID：201702242652203636   整理番号：17A1417076

UpSetR 積集合とそれらの特性の可視化のためのRパッケージ

UpSetR: an R package for the visualization of intersecting sets and their properties

著者 (3件)： CONWAY Jake R. (Harvard Medical School, MA, USA) ,  LEX Alexander (Univ. Utah, UT, USA) ,  GEHLENBORG Nils (Harvard Medical School, MA, USA)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 18  ページ： 2938-2940  発行年： 2017年09月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 積集合の定量的可視化のための一般的であるが不十分な解決法であるベン図やオイラー図のスケーラブルな代替法が必要とされている。本稿では,積集合,それらのサイズ,そして他の性質を示すためのスケーラブルな行列に基づく可視化を利用するオープンソースRパッケージUpSetRと,ウェブブラウザーで研究者が直接,印刷並の品質のUpSetプロットを作成できるShiny appを紹介する。UpSetRは,https://github.com/hms-dbmi/UpSetR/にて,Shiny appは,https://gehlenborglab.shinyapps.io/upsetr/にて利用可能である。

シソーラス用語： 集合 ,  *可視化 ,  プログラミング言語 ,  *プログラムパッケージ ,  *一塩基多型
準シソーラス用語： *積集合 ,  *Rパッケージ ,  SNP ,  *相同遺伝子

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (4件)： 積 ,  集合 ,  可視化 ,  Rパッケージ