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J-GLOBAL ID：201702242909646001   整理番号：17A1440867

新規栄養に対するEscherichia coliの進化的適応における再結合の役割【Powered by NICT】

The role of recombination in evolutionary adaptation of Escherichia coli to a novel nutrient

著者 (5件)： Chu H.-Y. (Department of Evolutionary Biology and Environmental Studies, University of Zurich, Zurich, Switzerland) ,  Sprouffske K. (Department of Evolutionary Biology and Environmental Studies, University of Zurich, Zurich, Switzerland) ,  Wagner A. (Department of Evolutionary Biology and Environmental Studies, University of Zurich, Zurich, Switzerland) ,  Wagner A. (The Swiss Institute of Bioinformatics, Quartier Sorge, Batiment Genopode, Lausanne, Switzerland) ,  Wagner A. (The Santa Fe Institute, Santa Fe, NM, USA)
資料名： Journal of Evolutionary Biology  (Journal of Evolutionary Biology)
巻： 30  号： 9  ページ： 1692-1711  発行年： 2017年 
JST資料番号： T0534A  ISSN： 1010-061X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 適応進化の再結合の利点と欠点を理論と実験で調べ,矛盾する予測と観測した。最も適切な実験は不変環境における再結合の効果を調べ,そのゲノムワイド効果を研究していない。ここでは,変化する環境における高再結合R~+または低いずれか再結合R~-E.coli株の六回の繰り返し集団を進化させ,環境へのL-アラビノースまたはインドールを新規栄養素を導入した。実験の祖先株はこれらの栄養素に実行可能ではないが,130世代の適応進化したそれらを実行可能にするために十分であった。組換はインドールに適応した個体群に顕著な利点を与えた。この利点に関連したゲノム変化を研究するために,実験の終了時に選択された複製から分離した384クローンのゲノム配列を決定した。これらゲノムは点突然変異から大規模DNA増幅に複雑な変化を持っている。いくつかの候補適応変異の中で,トリプトファナーゼ調節tnaCは傑出している,が存在するtnaオペロンはインドール代謝における既知役割を持つからである。高再結合集団の一つもtnaオペロンを含む大規模分節DNA増幅の顕著な過剰を示した。系統も互いに独立して発生し,組換による後に接合されなければならない可能性があることを点突然変異とDNA増幅のユニークで潜在的に適応的組合せを示した。著者らのデータは,適応進化の再結合の利点は環境に強く依存することを,複雑なゲノム変化と関連する可能性があることを示した。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 栄養素 ,  代謝 ,  クローン ,  個体群 ,  *大腸菌 ,  トリプトファナーゼ ,  ゲノム ,  *再結合 ,  点突然変異 ,  オペロン ,  窒素複素環化合物 ,  芳香族縮合化合物
準シソーラス用語： DNA増幅 ,  ゲノム配列 ,  適応進化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： 適応 ,  実験的進化 ,  ゲノミクス

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  微生物代謝産物の生産  (FK03020A)

物質索引 (2件)： インドール ,  L-アラビノース

タイトルに関連する用語 (6件)： 栄養 ,  Escherichia ,  進化 ,  適応 ,  再結合 ,  役割