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J-GLOBAL ID：201702243079031433   整理番号：17A1100103

qPCRのための合成生物学標準としてCAL1反応を評価するための細胞超音波処理物中のE.coliとバクテリオファージDNAの測定【Powered by NICT】

Measuring E. coli and bacteriophage DNA in cell sonicates to evaluate the CAL1 reaction as a synthetic biology standard for qPCR

著者 (3件)： Templar Alexander (The Advanced Centre for Biochemical Engineering, Department of Biochemical Engineering, University College London, WC1E 6BT, UK) ,  Schofield Desmond M. (The Advanced Centre for Biochemical Engineering, Department of Biochemical Engineering, University College London, WC1E 6BT, UK) ,  Nesbeth Darren N. (The Advanced Centre for Biochemical Engineering, Department of Biochemical Engineering, University College London, WC1E 6BT, UK)
資料名： Biomolecular Detection and Quantification  (Biomolecular Detection and Quantification)
巻： 11  ページ： 21-30  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3008A  ISSN： 2214-7535  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 絶対定量的PCR(LRE qPCR)の効率(LRE)法の線形回帰の性能に及ぼす全Escherichia coli(E.coli)細胞材料の存在,合成生物学標準として推定される普遍的CAL1キャリブレーション反応,著者らが提案しているを特徴とするの影響を測定した。の孤立ゲノムBirA遺伝子座に存在する配列は増幅されるqPCR反応を使用した。多くの定量的qPCR法で重要な計量,この反応のための増幅効率はバイオリアクタ培養振とうフラスコ培養からの材料よりも大幅にからセル状材料により阻害された。絶対qPCR(SC qPCR)の標準曲線法とLRE qPCRを比較した。振とうフラスコ派生細胞超音波処理物試料中に存在するBirA標的配列の417 4.17×10~7コピー,および等価バイオリアクタで培養された試料における97 9.7×10~5コピーを測定に用いた場合,LRE qPCR法はSC qPCRの性能と一致した。プラスミドにコードされたT7バクテリオファージ配列は次の方法を比較するために使用した。OD_600=160までの試料から細胞超音波処理物の存在下では,LRE qPCRはT7標的配列の1.54×10~8 1.54×10~10コピーの範囲でSC qPCRに優れており,1.54×10~4 1.54×10~7コピー上のSC qPCRと一致した。これらのデータは,未精製工業試料はテンプレート材料の源として使用したときでも,CAL1標準,LRE qPCR法と組み合わせて,良好に動作することを合成生物学qPCR標準として魅力的な選択である示唆した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 検量線 ,  *バクテリオファージ ,  ゲノム ,  *定量的PCR法 ,  *DNA【核酸】 ,  バイオリアクタ ,  プラスミド ,  培養 ,  標準化 ,  Escherichia
準シソーラス用語： 生細胞 ,  線形回帰 ,  ソニケーション ,  *構成的生物学 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Pcr ,  合成生物学 ,  標準曲線 ,  標準化 ,  線形回帰 ,  効率

分類 (1件)： 微生物検査法  (EG02020G)

タイトルに関連する用語 (8件)： qPCR ,  合成生物学 ,  標準 ,  評価 ,  細胞 ,  超音波処理 ,  バクテリオファージ ,  DNA