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J-GLOBAL ID：201702243339416383   整理番号：17A1389745

熱帯海洋環境下での海上生簀で飼育された3経済的に重要な魚類の微生物群集の比較プロファイリング【Powered by NICT】

Comparative profiling of microbial community of three economically important fishes reared in sea cages under tropical offshore environment

著者 (8件)： Rasheeda M.K. (Marine Biotechnology Division, Ocean Science and Technology for Islands Group, National Institute of Ocean Technology, Ministry of Earth Sciences (MoES), Government of India, Pallikaranai, Chennai, India) ,  Rangamaran Vijaya Raghavan (Marine Biotechnology Division, Ocean Science and Technology for Islands Group, National Institute of Ocean Technology, Ministry of Earth Sciences (MoES), Government of India, Pallikaranai, Chennai, India) ,  Srinivasan Senthilkumar (Marine Biotechnology Division, Ocean Science and Technology for Islands Group, National Institute of Ocean Technology, Ministry of Earth Sciences (MoES), Government of India, Pallikaranai, Chennai, India) ,  Ramaiah Sendhil Kumar (Marine Biotechnology Division, Ocean Science and Technology for Islands Group, National Institute of Ocean Technology, Ministry of Earth Sciences (MoES), Government of India, Pallikaranai, Chennai, India) ,  Gunasekaran Rajaprabhu (Marine Biotechnology Division, Ocean Science and Technology for Islands Group, National Institute of Ocean Technology, Ministry of Earth Sciences (MoES), Government of India, Pallikaranai, Chennai, India) ,  Jaypal Santhanakumar (Marine Biotechnology Division, Ocean Science and Technology for Islands Group, National Institute of Ocean Technology, Ministry of Earth Sciences (MoES), Government of India, Pallikaranai, Chennai, India) ,  Gopal Dharani (Marine Biotechnology Division, Ocean Science and Technology for Islands Group, National Institute of Ocean Technology, Ministry of Earth Sciences (MoES), Government of India, Pallikaranai, Chennai, India) ,  Ramalingam Kirubagaran (Marine Biotechnology Division, Ocean Science and Technology for Islands Group, National Institute of Ocean Technology, Ministry of Earth Sciences (MoES), Government of India, Pallikaranai, Chennai, India)
資料名： Marine Genomics  (Marine Genomics)
巻： 34  ページ： 57-65  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3299A  ISSN： 1874-7787  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ここでは養殖スギコバンアジとサバヒーの微生物組成,培養非依存的方法による海中かごで養殖されたを評価するために行った。本研究では,魚の一般的健康を評価し,将来のプロバイオティクス研究のための腸に存在し,潜在的病原体の早期検出における優占細菌種を同定するための基礎として使えるだろう。Illumina MiSeqプラットフォーム上の16S rDNAのV3-V4超可変領域のハイスループット配列決定は複合細菌集団の解明を容易にした。百三十万品質フィルタ配列の分析は,高い微生物多様性を示した。特性海産魚腸内微生物:Vibrio及びPhotobacterium spp.はスギとコバンアジにおける有病率を示したPelomonasとFusobacterium spp.は,サバヒーの腸を支配した。10,537操作的分類単位(OTU)とコバンアジの後腸は最高のalpha-diversity指数とそれに続くスギ(10,435)とサバヒー(2799)を示した。さらに各腸型におけるユニークなと共有OTUを同定した。Gammaproteobacteriaはスギとコバンアジで支配的であったBetaproteobacteriaがサバヒーの有病率を示した。リードの数は大きく変動したが,三種間の96共有OTUを得た。同じ環境で飼育された養殖魚の微生物相におけるこれらの違いは,腸形態,生理学的行動と宿主特異性の相違に起因すると考えられる。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 腸内微生物 ,  *微生物 ,  プロバイオティクス ,  Vibrio ,  培養 ,  *海洋環境 ,  *海洋 ,  病原体 ,  養殖 ,  ミクロフローラ
準シソーラス用語： 養殖魚 ,  微生物多様性 ,  細菌群集 ,  16S rDNA ,  Chanos chanos , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 微生物多様性 ,  海ケージ ,  Illumina MiSeq ,  宿主特異性

分類 (1件)： 微生物の生態  (EG03040J)

タイトルに関連する用語 (9件)： 熱帯 ,  海洋環境 ,  海上 ,  生簀 ,  飼育 ,  経済 ,  魚類 ,  微生物群集 ,  プロファイリング