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J-GLOBAL ID：201702243673459535   整理番号：17A1493038

アンプリコンベース超並列シーケンシングによる非小細胞肺癌の日本人患者における術前生検と対応する外科的に切除した標本の臨床的に意義のある変異プロファイルの比較【Powered by NICT】

Comparison of Clinically Relevant Mutation Profiles Between Preoperative Biopsy and Corresponding Surgically Resected Specimens in Japanese Patients With Non-Small-cell Lung Cancer by Amplicon-based Massively Parallel Sequencing

著者 (20件)： Isaka Mitsuhiro (Division of Thoracic Surgery, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Serizawa Masakuni (Drug Discovery and Development Division, Research Institute, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Kenmotsu Hirotsugu (Division of Thoracic Oncology, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Koh Yasuhiro (Drug Discovery and Development Division, Research Institute, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Koh Yasuhiro (Third Department of Internal Medicine, Wakayama Medical University, Kimiidera, Wakayama, Japan) ,  Takahashi Shoji (Division of Thoracic Surgery, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Maniwa Tomohiro (Division of Thoracic Surgery, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Wakuda Kazushige (Division of Thoracic Oncology, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Ono Akira (Division of Thoracic Oncology, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Naito Tateaki (Division of Thoracic Oncology, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Murakami Haruyasu (Division of Thoracic Oncology, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Mori Keita (Clinical Trial Coordination Office, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Endo Masahiro (Division of Diagnostic Radiology, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Abe Masato (Division of Pathology, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Hayashi Isamu (Division of Pathology, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Nakajima Takashi (Division of Pathology, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Yamamoto Nobuyuki (Division of Thoracic Oncology, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Yamamoto Nobuyuki (Third Department of Internal Medicine, Wakayama Medical University, Kimiidera, Wakayama, Japan) ,  Takahashi Toshiaki (Division of Thoracic Oncology, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan) ,  Ohde Yasuhisa (Division of Thoracic Surgery, Shizuoka Cancer Center, Nagaizumi-cho, Sunto-gun, Japan)
資料名： Clinical Lung Cancer  (Clinical Lung Cancer)
巻： 18  号： 5  ページ： 519-526.e1  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3210A  ISSN： 1525-7304  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： アンプリコンベースの大規模並列シークエンシング(MPS)は限られた量の組織の多くの遺伝子の臨床的に実施可能な変異を同定するための効果的なプラットフォームである。多くの肺癌は,経気管支生検(TBB)により得られた少量の組織試料を用いて診断と多段処理が貯留した。アンプリコンに基づくMPSにより検出されTBB試料の変異が腫瘍に存在するものを反映しているかどうかを調べるため,術前TBB試料と対応する外科的切除標本の変異プロファイルを比較した。術前TBBと外科的切除時に得られた非小細胞肺癌患者(n=46)からの新鮮凍結原発腫瘍試料を分析した。2試料タイプにおけるアンプリコンに基づくMPSにより検出された変異の一致を調べ,同一患者からの両試料に共通な突然変異の対立遺伝子頻度を決定した。DNA量の初期評価はTBB試料(46人中21人)の46%がアンプリコンに基づくMPSの下限以下であることを明らかにした。これら21TBB試料は分析から除外した。25患者からTBBおよび/または外科的切除標本で検出された29の変異のうち,23名が両試料に存在し,79%の一致率であった。TBB試験片を用いたアンプリコンベースのMPSは約臨床的に関連する腫瘍変異プロファイルを反映している。しかし,アンプリコンに基づくMPSに十分なDNA量とTBB試料の速度は僅か約50%であった。,外科的に切除した試料は予備的で包括的なゲノムプロファイリングにおける重要な役割を持っている。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *患者 ,  DNA【核酸】 ,  *外科学 ,  *肺腫瘍 ,  腫瘍 ,  突然変異 ,  *生検 ,  切除術 ,  *非小細胞肺癌 ,  遺伝子頻度 ,  遺伝子 ,  *アンプリコン ,  気管支鏡下生検 ,  *日本人 ,  *遺伝的変異 ,  *臨床検査 ,  遺伝 ,  集団遺伝
準シソーラス用語： *変異 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： アンプリコンベース大規模並行配列決定 ,  遺伝的変化 ,  NSCLC ,  外科標本 ,  経気管支生検標本

分類 (1件)： 呼吸器の腫よう  (GI04000G)

タイトルに関連する用語 (12件)： アンプリコン ,  超並列 ,  非小細胞肺癌 ,  日本人 ,  患者 ,  術前 ,  生検 ,  外科 ,  標本 ,  臨床 ,  変異 ,  プロファイル