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J-GLOBAL ID：201702244016890275   整理番号：17A1004414

sfinx 親和性精製-質量分析データセットからの偽陽性の除去のためのRパッケージ

sfinx: an R package for the elimination of false positives from affinity purification-mass spectrometry datasets

著者 (13件)： TITECA Kevin (VIB Medical Biotechnology Center, Ghent, BEL) ,  TITECA Kevin (Ghent Univ., Ghent, BEL) ,  MEYSMAN Pieter (Univ. Antwerp, Antwerp, BEL) ,  MEYSMAN Pieter (Univ. Antwerp, Edegem, BEL) ,  LAUKENS Kris (Univ. Antwerp, Antwerp, BEL) ,  LAUKENS Kris (Univ. Antwerp, Edegem, BEL) ,  MARTENS Lennart (VIB Medical Biotechnology Center, Ghent, BEL) ,  MARTENS Lennart (Ghent Univ., Ghent, BEL) ,  MARTENS Lennart (Ghent Univ., Zwijnaarde, BEL) ,  TAVERNIER Jan (VIB Medical Biotechnology Center, Ghent, BEL) ,  TAVERNIER Jan (Ghent Univ., Ghent, BEL) ,  EYCKERMAN Sven (VIB Medical Biotechnology Center, Ghent, BEL) ,  EYCKERMAN Sven (Ghent Univ., Ghent, BEL)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 12  ページ： 1902-1904  発行年： 2017年06月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 親和性精製-質量分析データセットにおける陽性および偽陽性蛋白質相互作用の分離のための簡単なフィルタリングインデックス(sfinx)へのアクセスを与えるRパッケージについて述べた。このパッケージはSFINXウェブサイトインタフェイスの信頼性およびユーザーフレンドリー性を維持しながら,迅速であり,インプットサイズの制限がなく,Rパッケージ内で局所的に実行される。

シソーラス用語： 親和性 ,  精製 ,  *質量分析 ,  集合 ,  *データ ,  検出 ,  *プログラミング言語 ,  *プログラムパッケージ ,  分子間相互作用 ,  タンパク質 ,  タンパク質結合 ,  フィルタリング ,  索引 ,  Web【情報システム】 ,  インタフェイス ,  信頼性 ,  性質 ,  人間機械系 ,  入力
準シソーラス用語： *データセット ,  偽陽性 ,  *Rパッケージ ,  蛋白質相互作用 ,  インデックス ,  Webサイト ,  ユーザフレンドリ性 ,  インプット

分類 (2件)： 質量分析  (CC03013N) ,  数値計算  (JE02000J)

タイトルに関連する用語 (6件)： 親和性 ,  精製 ,  質量分析 ,  データセット ,  偽陽性 ,  Rパッケージ