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J-GLOBAL ID：201702244494555242   整理番号：17A0518053

アンサンブルに基づく熱力学的積分を用いた,迅速,精確,精密,信頼性の高い相対自由エネルギー予測

Rapid, Accurate, Precise, and Reliable Relative Free Energy Prediction Using Ensemble Based Thermodynamic Integration

著者 (4件)： BHATI Agastya P. (Univ. Coll. London, London, GBR) ,  WAN Shunzhou (Univ. Coll. London, London, GBR) ,  WRIGHT David W. (Univ. Coll. London, London, GBR) ,  COVENEY Peter V. (Univ. Coll. London, London, GBR)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 13  号： 1  ページ： 210-222  発行年： 2017年01月 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ここ数年,速度,精度,精密度,および信頼性の要件を満たす分子力学Poisson-Boltzmann法に基づいて,自由エネルギーの信頼できる予測へのルートを与えるアンサンブルベースの分子動力学アプローチが提案された。本論文の目的は,再現性が高く,精確で精密な相対的結合親和性を生じる,強化されたサンプリング(TIES)を持つ熱力学的積分と呼ばれる新しい方法を述べることである。蛋白質標的および配位子の多様なセットに適用した場合のこの方法の性能を報告した。結果は実験データと非常によく一致する(計算の90%は1kcal/mol以内で一致する)。0.5kcal/mol以下のオーダーの統計的不確実性を達成した。予測の不確実性をどのように見積もるかを体系的に述べた。

シソーラス用語： *分子内力学 ,  *自由エネルギー ,  分子動力学 ,  親和性 ,  タンパク質 ,  配位子 ,  不確実性 ,  集合 ,  *積分 ,  標本抽出
準シソーラス用語： *分子力学 ,  結合親和性 ,  アンサンブル

分類 (3件)： 分子の性質一般  (BH05031D) ,  物理化学一般  (CB01010X) ,  化学熱力学・熱化学一般  (CB02010E)

タイトルに関連する用語 (6件)： アンサンブル ,  熱力学的積分 ,  精確 ,  精密 ,  自由エネルギー ,  予測