文献

J-GLOBAL ID：201702244784639764   整理番号：17A0991687

スーパー-n-モチーフモデル RNA二次構造を表し比較するための新しいアライメントフリーアプローチ

The super-n-motifs model: a novel alignment-free approach for representing and comparing RNA secondary structures

著者 (3件)： GLOUZON Jean-Pierre Sehi (Univ. Sherbrooke, QC, CAN) ,  PERREAULT Jean-PIERRE (Univ. Sherbrooke, QC, CAN) ,  WANG Shengrui (Univ. Sherbrooke, QC, CAN)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 8  ページ： 1169-1178  発行年： 2017年04月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNA二次構造の比較は,RNA機能のより良い理解に繋がりうる構造パターンを明らかにするが,直鎖か環状かや,シュードノットやグアニン四重鎖,そしてハイスループット技術により生じつつある大量の二次構造を考慮すると,正確な比較は挑戦的である。これに取り組むため,基本的モチーフだけでなく隣接関係も含む改良モチーフの潜在的解析に基づくスーパー-n-モチーフモデルを提唱する。このモデルは,既存の手法に比べ正確であるだけでなく,より迅速に比較を実行できる。本モデルはhttp://jpsglouzon.github.io/supernmotifs/にて利用可能である。

シソーラス用語： *二次構造 ,  迅速分析 ,  *分子モデル ,  *アルゴリズム ,  データ
準シソーラス用語： *RNA二次構造 ,  *迅速解析 ,  *モチーフ ,  大規模データ

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (3件)： モチーフ ,  モデル ,  RNA二次構造