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J-GLOBAL ID：201702244851692168   整理番号：17A1417059

GLANET ゲノム座位注釈づけおよび濃縮ツール

GLANET: genomic loci annotation and environment tool

著者 (4件)： OTLU Burcak (Middle East Technical Univ., Ankara, TUR) ,  FIRTINA Can (Bilkent Univ. Ankara, TUR) ,  KELES Suenduez (Univ. Wisconsin-Madison, WI, USA) ,  TASTAN Oznur (Bilkent Univ. Ankara, TUR)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 18  ページ： 2818-2828  発行年： 2017年09月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本稿で紹介するGC含量および/またはマップ可能性バイアスを説明するサンプリングに基づく濃縮テストを実装する包括的な注釈づけおよび濃縮分析ツールGLANETは,次世代シーケンシングによるゲノム研究が同定する遺伝的変異,転写因子占有,あるいはヒストン修飾に対応する座位を注釈づけし,濃縮分析を実行する。そのソースコードは,https://github.com/burcakotlu/GLANETにて入手可能である。

シソーラス用語： 遺伝学実験技術 ,  *塩基組成 ,  *ヌクレオチド配列 ,  *変異 ,  化学修飾
準シソーラス用語： *分子配列アノテーション ,  GC含量 ,  *次世代シーケンシング ,  遺伝的変異 ,  ヒストン修飾 ,  *経路濃縮分析

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (5件)： ゲノム ,  座位 ,  注釈 ,  濃縮 ,  ツール