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J-GLOBAL ID：201702244878755497   整理番号：17A1970688

リポ多糖類(LPS)感染に応答したアメリカザリガニ(Procambarus clarkii)肝すい臓のトランスクリプトームプロファイリング【Powered by NICT】

Transcriptome profiling of red swamp crayfish (Procambarus clarkii) hepatopancreas in response to lipopolysaccharide (LPS) infection

著者 (5件)： Zhou Miao (School of Pharmaceutical Sciences, Wenzhou Medical University, Wenzhou 325035, PR China) ,  Abbas Muhammad Nadeem (Department of Zoology and Fisheries, University of Agriculture, Faisalabad 38000, Pakistan) ,  Kausar Saima (Department of Zoology and Fisheries, University of Agriculture, Faisalabad 38000, Pakistan) ,  Jiang Cheng-Xi (Life Sciences Institute, Wenzhou University, Wenzhou 325035, PR China) ,  Dai Li-Shang (School of Pharmaceutical Sciences, Wenzhou Medical University, Wenzhou 325035, PR China)
資料名： Fish & Shellfish Immunology  (Fish & Shellfish Immunology)
巻： 71  ページ： 423-433  発行年： 2017年 
JST資料番号： W1617A  ISSN： 1050-4648  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNA配列とそれに続くde novo集合はP.clarkii肝すい臓の61,912個の単一遺伝子配列を生成した。LPS間の遺伝子発現の比較は挑戦し,PBS対照試料は2552の差次的に発現した遺伝子(DEGs)を明らかにした。これらの配列のうち,1162DEGした差次的にアップレギュレートされ,1360DEG特異的にダウンレギュレートされた。DEGを遺伝子オントロジー(GO)データベースとKyoto Encyclopediaof Genes and Genomes(KEGG)データベースの注釈された。PPARシグナル伝達経路,リソソーム,化学発癌,ペルオキシソームのようないくつかの免疫関連経路は正準経路解析によって予測された。トランスクリプトームデータの信頼性は選択された遺伝子の定量的リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応(qRT PCR)によって検証した。ここに示したデータはザリガニの抗菌免疫応答を明らかにした。加えて,これらの結果は,トランスクリプトームデータは免疫関連遺伝子同定のための貴重な配列資源を提供し,P.clarkii免疫機能を理解するのに役立つことを示唆した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *ザリガニ類 ,  免疫反応 ,  *感染 ,  遺伝子 ,  リソソーム ,  *リポ多糖類 ,  *アメリカザリガニ ,  データベース ,  遺伝子発現 ,  RNA【核酸】
準シソーラス用語： 遺伝子同定 ,  定量的リアルタイムPCR法 ,  遺伝子オントロジー ,  遺伝子配列 ,  *肝膵臓 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ザリガニ ,  LPS ,  免疫 ,  微分発現遺伝子 ,  節足動物

分類 (1件)： 免疫反応一般  (ED03010T)

タイトルに関連する用語 (7件)： リポ多糖類 ,  LPS ,  感染 ,  応答 ,  アメリカザリガニ ,  Procambarus ,  肝すい臓