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J-GLOBAL ID：201702245506903073   整理番号：17A1207708

希少疾患に関与する同定病原性変異体のための高速連想検査【Powered by NICT】

A Fast Association Test for Identifying Pathogenic Variants Involved in Rare Diseases

著者 (7件)： Greene Daniel (Department of Haematology, University of Cambridge, Cambridge Biomedical Campus, Cambridge CB2 0XY, UK) ,  Greene Daniel (NHS Blood and Transplant, Cambridge Biomedical Campus, Cambridge CB2 0PT, UK) ,  Greene Daniel (Medical Research Council Biostatistics Unit, Cambridge Biomedical Campus, Cambridge CB2 0SR, UK) ,  Richardson Sylvia (Medical Research Council Biostatistics Unit, Cambridge Biomedical Campus, Cambridge CB2 0SR, UK) ,  Turro Ernest (Department of Haematology, University of Cambridge, Cambridge Biomedical Campus, Cambridge CB2 0XY, UK) ,  Turro Ernest (NHS Blood and Transplant, Cambridge Biomedical Campus, Cambridge CB2 0PT, UK) ,  Turro Ernest (Medical Research Council Biostatistics Unit, Cambridge Biomedical Campus, Cambridge CB2 0SR, UK)
資料名： American Journal of Human Genetics  (American Journal of Human Genetics)
巻： 101  号： 1  ページ： 104-114  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0360B  ISSN： 0002-9297  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Bayesモデル比較を用いた稀な遺伝性疾患と関連する遺伝子座を同定するための迅速で強力な推論手順を提示した。ベースラインモデルの下で,疾患リスクが,試験のすべての個人間で固定されている。会合モデルの下で,疾病リスクは病原性および非病原性変異体への稀な変異体,各個人が持つ病原性対立遺伝子の数,および遺伝様式の潜在分割に依存する。会合の存在と各変異体の病原性と遺伝様式を表すパラメータを示すパラメータは,Bayesフレームワークにおける推論できる。対立遺伝子頻度データベース,結果予測アルゴリズム,またはゲノムデータセットから導出した変異体に特異的な事前情報が,推論に組み込むことができた。モデルは遺伝子座における変異体の異なるサブセットに適合させ,モデル選択法を用いて比較することができる。特別なクラスの変異体が疾患リスクを与え,クラスに関連した特定の疾患病因を示唆するのみならばこの方法は推論を向上させることができる。BeviMedと呼ばれる,この方法は優性および劣性異常という状況下での既存のまれなバリアント関連づけの方法よりもより強力で有益なことを示した。このアルゴリズムの高い計算効率は,ゲノムの大きな非コード画分に関連を試験するために可能となった。多様な稀な疾患のある6,586の個人の全ゲノム配列決定データにBeviMedを適用した。は稀な疾患に関与する複数の遺伝子座を同定することができることを示したが,遺伝,病原性変異体,および原因となる変異体クラスのモードを推定する。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： データベース ,  ゲノム ,  対立遺伝子 ,  Bayes推定 ,  遺伝病 ,  病因 ,  *病原性 ,  モデリング ,  アルゴリズム ,  遺伝 ,  優性 ,  遺伝子頻度 ,  *変異
準シソーラス用語： ゲノム配列 ,  遺伝パターン ,  発症リスク , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 希少疾患 ,  メンデル疾患 ,  遺伝性障害 ,  稀な変異 ,  まれなバリアント関連づけ試験 ,  Bayes推論 ,  全ゲノム配列決定

分類 (3件)： 図形・画像処理一般  (JE04010I) ,  菌類による植物病害  (FC04052Y) ,  システム・制御理論一般  (IA02010H)

タイトルに関連する用語 (4件)： 希少疾患 ,  同定 ,  病原性 ,  変異体