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J-GLOBAL ID：201702245524440931   整理番号：17A1590772

16S rRNAとsecA1遺伝子による臨床ノロウイルスを構築する系統樹の比較【JST・京大機械翻訳】

Comparison of Phylogeny of Clinical Nocardia Species Based on 16S rRNA and secA1 Gene Sequences

著者 (9件)： Wang Yanyan (貴州医科大学微生物学教研室,貴州貴陽,550025) ,  Xia Maoning (貴州医科大学微生物学教研室,貴州貴陽,550025) ,  Ou Weizheng (貴陽市公共衛生救治中心,貴州貴陽,550003) ,  Huang Jin (貴州医科大学生化与分子生物学教研室,貴州貴陽,550025) ,  Ming Chunyan (貴州医科大学微生物学教研室,貴州貴陽,550025) ,  Liu Taohua (貴州医科大学微生物学教研室,貴州貴陽,550025) ,  Lv Qian (貴州医科大学微生物学教研室,貴州貴陽,550025) ,  Zhou Bing (貴州医科大学微生物学教研室,貴州貴陽,550025) ,  Kang Yingqian (貴州医科大学微生物学教研室,貴州貴陽,550025)
資料名： Guizhou Yike Daxue Xuebao  (Guizhou Yike Daxue Xuebao)
巻： 42  号： 4  ページ： 409-415  発行年： 2017年 
JST資料番号： C3568A  ISSN： 2096-8388  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的;16S rRNAとsecA1遺伝子を比較することにより、Nocardia wallacei、Nocardia farcinica、Nocardia cyriacigeorgica及びNocardia otitidiscaviarumの4種の系統樹の多様性を構築した。方法;8株の臨床分離株をそれぞれ脳心浸出液寒天培地で分離培養し、その生長状況を観察した。細菌DNAを抽出し、ポリメラーゼ連鎖反応により16SrRNAとsecA1遺伝子配列を増幅し、配列決定し、得られた配列はNCBIデータベースとBLAST比較を行い、その菌種名を同定した。本研究で同定された4つの属に属する40の有効な発表種と本研究で分離した8株のノック菌株の種を選び、隣接法、最尤法によりそれぞれ16S rRNAとsecA1遺伝子配列の系統樹を構築し比較した。結果;本研究所で収集したNocardia wallacei,Nocardia farcinica,Nocardia cyriacigeorgica及びNocardia otitidiscaviarumの4つの種がある。さらに,Nocardia wallacei,Nocardia farcinica,およびNocardia cyriacigeorgicaは,16S rRNAと比較して高い分化度と多様性を示した(P<0.05)。Nocardia otitidiscaviarumの分化度と分類の多様性は16S rRNAとsecA1遺伝子で構築された系統樹の間に有意差がなかった(P>0.05)。結論;secA1遺伝子はノロウイルスの個体群の系統発生分析と分子進化の研究に用いられ、16S rRNAより高い分解能の優位性がある。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ノロウイルス ,  臨床分離菌 ,  *系統樹 ,  分子進化 ,  データベース ,  *rRNA ,  *遺伝子 ,  Nocardia ,  最尤法 ,  PCR法
準シソーラス用語： 系統解析 ,  菌株 ,  BLAST ,  遺伝子配列 ,  *16S rRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： gene ,  structural ,  bacteria ,  acitinomyces ,  development biology ,  Nocardia ,  16S rRNA gene ,  secA1 gene ,  polymerase chain reaction

分類 (2件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： rRNA ,  遺伝子 ,  臨床 ,  ノロウイルス ,  構築 ,  系統樹