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J-GLOBAL ID：201702245786494326   整理番号：17A1718800

癌におけるゲノムコピー数変異の広範な転写後減衰【Powered by NICT】

Widespread Post-transcriptional Attenuation of Genomic Copy-Number Variation in Cancer

著者 (9件)： Goncalves Emanuel (European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Wellcome Genome Campus, Cambridge CB10 1SD, UK) ,  Fragoulis Athanassios (Molecular Tumor Biology, Department of General, Visceral and Transplantation Surgery, RWTH University Hospital, Pauwelsstrasse 30, 52074 Aachen, Germany) ,  Garcia-Alonso Luz (European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Wellcome Genome Campus, Cambridge CB10 1SD, UK) ,  Cramer Thorsten (Molecular Tumor Biology, Department of General, Visceral and Transplantation Surgery, RWTH University Hospital, Pauwelsstrasse 30, 52074 Aachen, Germany) ,  Cramer Thorsten (NUTRIM School of Nutrition and Translational Research in Metabolism, Maastricht University, Maastricht, the Netherlands) ,  Cramer Thorsten (ESCAM - European Surgery Center Aachen Maastricht, Germany and the Netherlands) ,  Saez-Rodriguez Julio (European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Wellcome Genome Campus, Cambridge CB10 1SD, UK) ,  Saez-Rodriguez Julio (RWTH Aachen University, Faculty of Medicine, Joint Research Centre for Computational Biomedicine, 52057 Aachen, Germany) ,  Beltrao Pedro (European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Wellcome Genome Campus, Cambridge CB10 1SD, UK)
資料名： Cell Systems  (Cell Systems)
巻： 5  号： 4  ページ： 386-398.e4  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3087A  ISSN： 2405-4712  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： コピー数変動(CNVs)は癌に遍在し,しばしば運転者事象として作用するが,腫瘍のプロテオームに対するCNVsの影響はほとんど理解されていない。ここでは,最近発表されたゲノミクス,トランスクリプトミクス,およびプロテオミクスデータセットのこれらの細胞のプロテオームにおけるCNVの影響を調べるために282乳癌,卵巣癌および結腸直腸腫瘍試料にCPTACとTCGAコンソーシアによる利用を解析した。CNVsは蛋白質複合体メンバーで有意に濃縮された蛋白質の23%~ 33%の転写後調節により緩衝されることを見出した。著者らの分析は,複合体サブユニットは高度に共調節,いくつかは複合体集合の律速段階として作用することを示し,それらの減少は,他の複合体メンバーの豊度減少を誘導する。そして四十八のそのような律速相互作用を同定し,GTF2E1とAP3M1とGTF2E2とAP3B1の相互作用に関する著者らの予測を実験的に確認した。本研究では,細胞は変化したゲノムに対処することを可能にする癌における転写後機構の重要性を強調した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 乳房腫瘍 ,  プロテオーム ,  相互作用 ,  複合体 ,  卵巣腫瘍 ,  *ゲノム ,  プロテオミクス ,  サブユニット ,  *コピー数 ,  タンパク質複合体 ,  タンパク質 ,  律速
準シソーラス用語： 転写後調節 ,  トランスクリプトーム解析 ,  ゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 癌 ,  遺伝子量 ,  プロテオミクス ,  コピー数変動 ,  蛋白質複合体

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： 癌 ,  ゲノム ,  コピー数 ,  変異 ,  転写 ,  減衰