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J-GLOBAL ID：201702246112675930   整理番号：17A1209872

ヒトシグナル伝達のアラニン走査変異誘発と喪失または機能獲得変異体を推定するための転写1の活性化因子【Powered by NICT】

Alanine-scanning mutagenesis of human signal transducer and activator of transcription 1 to estimate loss- or gain-of-function variants

著者 (45件)： Kagawa Reiko (Department of Pediatrics, Hiroshima University Graduate School of Biomedical & Health Sciences, Hiroshima, Japan) ,  Fujiki Ryoji (Department of Technology Development, Kazusa DNA Research Institute, Chiba, Japan) ,  Tsumura Miyuki (Department of Pediatrics, Hiroshima University Graduate School of Biomedical & Health Sciences, Hiroshima, Japan) ,  Sakata Sonoko (Department of Pediatrics, Hiroshima University Graduate School of Biomedical & Health Sciences, Hiroshima, Japan) ,  Nishimura Shiho (Department of Pediatrics, Hiroshima University Graduate School of Biomedical & Health Sciences, Hiroshima, Japan) ,  Itan Yuval (St. Giles Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases, Rockefeller Branch, Rockefeller University, New York, NY) ,  Kong Xiao-Fei (St. Giles Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases, Rockefeller Branch, Rockefeller University, New York, NY) ,  Kato Zenichiro (Department of Pediatrics, Graduate School of Medicine, Gifu University, Gifu, Japan) ,  Kato Zenichiro (Structural Medicine, United Graduate School of Drug Discovery and Medical Information Sciences, Gifu University, Gifu, Japan) ,  Ohnishi Hidenori (Department of Pediatrics, Graduate School of Medicine, Gifu University, Gifu, Japan) ,  Hirata Osamu (Department of Pediatrics, Hiroshima University Graduate School of Biomedical & Health Sciences, Hiroshima, Japan) ,  Saito Satoshi (Department of Pediatrics, Hiroshima University Graduate School of Biomedical & Health Sciences, Hiroshima, Japan) ,  Ikeda Maiko (Department of Pediatrics, Okazaki City Hospital, Aichi, Japan) ,  El Baghdadi Jamila (Genetics Unit, Military Hospital Mohamed V, Hay Riad, Rabat, Morocco) ,  Bousfiha Aziz (Laboratory of Clinical Immunology, Inflammation and Allergy, Faculty of Medicine and Pharmacy, Hassan II University of Casablanca, Casablanca, Morocco) ,  Bousfiha Aziz (Clinical Immunology Unit, Department of Pediatric Infectious Diseases, Averroes University Hospital, Casablanca, Morocco) ,  Fujiwara Kaori (Department of Pediatrics, National Hospital Organization Fukuyama Medical Center, Hiroshima, Japan) ,  Oleastro Matias (Department of Immunology, “Juan Pedro Garrahan” National Hospital of Pediatrics, Buenos Aires, Argentina) ,  Yancoski Judith (Department of Immunology, “Juan Pedro Garrahan” National Hospital of Pediatrics, Buenos Aires, Argentina) ,  Perez Laura (Department of Immunology, “Juan Pedro Garrahan” National Hospital of Pediatrics, Buenos Aires, Argentina) ,  Danielian Silvia (Department of Immunology, “Juan Pedro Garrahan” National Hospital of Pediatrics, Buenos Aires, Argentina) ,  Ailal Fatima (Laboratory of Clinical Immunology, Inflammation and Allergy, Faculty of Medicine and Pharmacy, Hassan II University of Casablanca, Casablanca, Morocco) ,  Ailal Fatima (Clinical Immunology Unit, Department of Pediatric Infectious Diseases, Averroes University Hospital, Casablanca, Morocco) ,  Takada Hidetoshi (Department of Pediatrics, Graduate School of Medical Sciences, Kyushu University, Fukuoka, Japan) ,  Hara Toshiro (Department of Pediatrics, Graduate School of Medical Sciences, Kyushu University, Fukuoka, Japan) ,  Puel Anne (St. Giles Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases, Rockefeller Branch, Rockefeller University, New York, NY) ,  Puel Anne (Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases, Necker Branch, INSERM U1163, Paris, France) ,  Puel Anne (Paris Descartes University, Sorbonne Paris Cite, Imagine Institute, Paris, France) ,  Boisson-Dupuis Stephanie (St. Giles Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases, Rockefeller Branch, Rockefeller University, New York, NY) ,  Boisson-Dupuis Stephanie (Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases, Necker Branch, INSERM U1163, Paris, France) ,  Boisson-Dupuis Stephanie (Paris Descartes University, Sorbonne Paris Cite, Imagine Institute, Paris, France) ,  Bustamante Jacinta (St. Giles Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases, Rockefeller Branch, Rockefeller University, New York, NY) ,  Bustamante Jacinta (Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases, Necker Branch, INSERM U1163, Paris, France) ,  Bustamante Jacinta (Paris Descartes University, Sorbonne Paris Cite, Imagine Institute, Paris, France) ,  Bustamante Jacinta (Center for the Study of Primary Immunodeficiencies, Assistance Publique-Hopitaux de Paris, Paris, France) ,  Casanova Jean-Laurent (St. Giles Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases, Rockefeller Branch, Rockefeller University, New York, NY) ,  Casanova Jean-Laurent (Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases, Necker Branch, INSERM U1163, Paris, France) ,  Casanova Jean-Laurent (Paris Descartes University, Sorbonne Paris Cite, Imagine Institute, Paris, France) ,  Casanova Jean-Laurent (Pediatric Hematology-Immunology Unit, Assistance Publique-Hopitaux de Paris, Necker Hospital for Sick Children, Paris, France) ,  Casanova Jean-Laurent (Howard Hughes Medical Institute, New York, NY) ,  Ohara Osamu (Department of Technology Development, Kazusa DNA Research Institute, Chiba, Japan) ,  Ohara Osamu (Laboratory for Integrative Genomics, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, Yokohama, Japan) ,  Okada Satoshi (Department of Pediatrics, Hiroshima University Graduate School of Biomedical & Health Sciences, Hiroshima, Japan) ,  Okada Satoshi (St. Giles Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases, Rockefeller Branch, Rockefeller University, New York, NY) ,  Kobayashi Masao (Department of Pediatrics, Hiroshima University Graduate School of Biomedical & Health Sciences, Hiroshima, Japan)
資料名： Journal of Allergy and Clinical Immunology  (Journal of Allergy and Clinical Immunology)
巻： 140  号： 1  ページ： 232-241  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0182B  ISSN： 0091-6749  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒトシグナルトランスデューサーと転写活性化剤1(STAT1)における生殖細胞系ヘテロ接合性変異は,マイコバクテリア症に対するメンデル感受性患者のように,関数(LOF)の消失または機能の獲得(GOF)を引き起こす可能性がある慢性粘膜皮膚カンジダ症患者である。LOFおよびGOF変異は等しくまれとSTAT1の同じドメイン,特にコイルドコイルドメイン(CCD)とDNA結合ドメイン(DBD)に影響を与えることができる。さらに,GOF STAT1変異を有する慢性粘膜皮膚カンジダ症患者の6%が抗酸菌症を有し,同定されたSTAT1変異の機能的重要性を不明瞭にする。複合アノテーション依存的消耗のような現行の計算機利用アプローチはLOFおよびGOF変異体を区別しない。STAT1のCCD/DBDの変化を推定した。CCD/DBD(全長STAT1の45.6%)における342種の個々の野生型アミノ酸を変異アラニンとSTAT1転写活性に変異体を試験した。これら342変異体のうち,201は中性,30はLOFし,111は,ルシフェラーゼ分析でGOF突然変異であった。このアッセイ系はSTAT1のCCD/DBDにおけるすべての以前に報告されたLOF変異(100%)とわずかに少ないGOF変異(78.1%)を推定した。GOFアラニン変異体は逆平行STAT1二量体の界面で発生し,それらがこの二量体を不安定化することを示唆した。このアッセイは,マイコバクテリア症に対するメンデル感受性の無血縁関係2患者で見られるものSTAT1のCCDにおける2低形質とドミナントネガティブ突然変異の影響を予測し,E157KとG250E,正確に。系統的アラニン走査分析は,重症感染症患者で同定されたGOFまたはLOF状態とSTAT1のヘテロ接合性ミスセンス突然変異の影響を推定するために有用なツールである,Mycobacteriumおよび真菌疾患を含む。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 感受性 ,  *変異誘発 ,  ルシフェラーゼ ,  *変異 ,  データベース ,  *ヒト ,  アミノ酸 ,  患者 ,  ミスセンス突然変異 ,  二量体 ,  計算機利用 ,  野生型 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： 転写活性 ,  STAT1転写因子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 転写1の伝達と活性化因子を信号キーワード ,  アラニン走査 ,  慢性粘膜皮膚カンジダ症 ,  マイコバクテリア症に対するメンデル感受性 ,  参照データベース

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  細胞膜の受容体  (EF04030C) ,  生物学的機能  (EB03040U)

物質索引 (1件)： アラニン

タイトルに関連する用語 (9件)： ヒト ,  シグナル伝達 ,  アラニン ,  走査 ,  変異誘発 ,  獲得 ,  変異体 ,  推定 ,  転写