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J-GLOBAL ID：201702246418791413   整理番号：17A1215977

ニューロン分化中の調査はスプライシング動力学を用いた単一細胞選択的スプライシング解析【Powered by NICT】

Single-Cell Alternative Splicing Analysis with Expedition Reveals Splicing Dynamics during Neuron Differentiation

著者 (14件)： Song Yan (Department of Cellular and Molecular Medicine, Stem Cell Program and Institute for Genomic Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Botvinnik Olga B. (Department of Cellular and Molecular Medicine, Stem Cell Program and Institute for Genomic Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Botvinnik Olga B. (Bioinformatics and Systems Biology Graduate Program, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Lovci Michael T. (Department of Cellular and Molecular Medicine, Stem Cell Program and Institute for Genomic Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Lovci Michael T. (Biomedical Sciences Graduate Program, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Kakaradov Boyko (Department of Cellular and Molecular Medicine, Stem Cell Program and Institute for Genomic Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Kakaradov Boyko (Bioinformatics and Systems Biology Graduate Program, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Liu Patrick (Department of Cellular and Molecular Medicine, Stem Cell Program and Institute for Genomic Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Xu Jia L. (Department of Cellular and Molecular Medicine, Stem Cell Program and Institute for Genomic Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Yeo Gene W. (Department of Cellular and Molecular Medicine, Stem Cell Program and Institute for Genomic Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Yeo Gene W. (Bioinformatics and Systems Biology Graduate Program, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Yeo Gene W. (Biomedical Sciences Graduate Program, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Yeo Gene W. (Department of Physiology, Yong Loo Lin School of Medicine, National University of Singapore, Singapore 119077, Singapore) ,  Yeo Gene W. (Molecular Engineering Laboratory, ASTAR, Singapore 138632, Singapore)
資料名： Molecular Cell  (Molecular Cell)
巻： 67  号： 1  ページ： 148-161.e5  発行年： 2017年 
JST資料番号： W1167A  ISSN： 1097-2765  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 選択的スプライシング(AS)は細胞同一性とホメオスタシス多細胞生物のためのイソ型の多様性を発生させる。AS変化は単一細胞間で観察されているが,このような変化の生物学的または進化論的意義についてはほとんど知られていない。ASを検出するための調査,アウトリガーの計算フレームワークからなる,de novoスプライスグラフトランスバーサルアルゴリズムを開発した。アンカー,モダリティを帰属するためのBayesアプローチbonvoyage,様式変化を表示するための非負行列因子分解を用いた可視化ツール。神経分化を受ける単一多能性幹細胞への探検を適用して,著者らは,ASエキソンの20%までが二峰性を示すことを発見した。二峰性エキソンは異なるシス調節モチーフを持つより保存されたイントロン配列により側面をみせる,細胞型特異的スプライシングの多くを構成する,細胞転移の間は高度に動的であり,リーディングフレームを保存し,従来の遺伝子発現解析に見えない細胞状態の複雑さを明らかにした。単一細胞における系統的として特性化は細胞生物学におけるASの複雑性の理解を再定義する。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： イントロン ,  *ニューロン ,  細胞生物学 ,  ホメオスタシス ,  *分化 ,  *選択的スプライシング ,  多能性幹細胞 ,  キャラクタリゼーション
準シソーラス用語： 遺伝子発現プロファイリング ,  細胞型 ,  神経分化 ,  非負行列因子分解 ,  アイソフォーム ,  多細胞生物 ,  *単一細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： 単一細胞 ,  選択的スプライシング ,  RNAプロセシング ,  幹細胞 ,  ニューロン ,  differentiation ,  転写後 ,  modality ,  双峰性

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： ニューロン ,  分化 ,  調査 ,  スプライシング ,  動力学 ,  単一細胞 ,  選択的スプライシング ,  解析