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J-GLOBAL ID：201702246423388402   整理番号：17A1407185

Chinese Jujube(Ziziphus jujuba Mill.)中のSBPボックス遺伝子ファミリーの全ゲノム中での構成と発現プロファイル

Genome-Wide Organization and Expression Profiling of the SBP-Box Gene Family in Chinese Jujube (Ziziphus jujuba Mill.)

著者 (6件)： SONG Shuang (Beijing Forestry Univ., Beijing, CHN) ,  ZHOU Heying (Beijing Forestry Univ., Beijing, CHN) ,  SHENG Songbai (Beijing Forestry Univ., Beijing, CHN) ,  CAO Ming (National Foundation for Improved Cultivar of Chinese Jujube, Cangzhou, CHN) ,  LI Yingyue (Beijing Forestry Univ., Beijing, CHN) ,  PANG Xiaoming (Beijing Forestry Univ., Beijing, CHN)
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 18  号： 8  ページ： WEB ONLY  発行年： 2017年08月 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 転写因子は,植物の発生過程において重要な役割を果たしている。SQUAMOSAプロモータ結合蛋白質(SBP)遺伝子は,植物特異的な転写因子をコードしており,植物の発生において多くの重要な役割を果たしている。本研究では,Ziziphus jujuba Mill. Dongzao(Dongzao)中で16種のSBPボックス遺伝子ファミリーメンバを同定したが,これら遺伝子は,8つの染色体上に分布していた。それらは,他のSBPボックス遺伝子ファミリーとの系統的な関係により,7つのグループに分類された。各グループ中では,遺伝子は相同的なエキソン-イントロン構造とモチーフの局在を示していた。エキソンの数は,グループ間で異なっていた。ここでは,Dongzaoとシロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)間で12の相同な遺伝子ペアを同定した。発現プロファイルによると,ZjSBP02とZjSBP14は,成熟した果実中で高発現しており,ZjSBP01は,他の組織に比べ成熟した葉で高発現しており,ZjSBP12は,花で極めて強く発現していた。トランスクリプトーム解析では,ZiSBP遺伝子群は,様々な組織で異なる発現パターンを示していた。以上のように,本研究は,Z. jujubaにおけるSBPボックス遺伝子ファミリーに関する最初の体系的な解析である。本論文に記載したデータは,植物の成長と発生におけるZjSBP遺伝子の重要な役割を理解するための基盤を提供する。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *クロウメモドキ科 ,  遺伝子 ,  解析 ,  遺伝学 ,  *遺伝子発現 ,  *転写因子 ,  エキソン ,  イントロン ,  Arabidopsis thaliana ,  遺伝学実験技術 ,  分子構造 ,  ゲノム ,  ヌクレオチド配列 ,  トランスクリプトーム ,  アミノ酸配列 ,  系統樹 ,  生物分類
準シソーラス用語： Ziziphus jujuba ,  遺伝子ファミリー ,  *遺伝子分析 ,  ゲノム解析 ,  *SQUAMOSAプロモータ結合蛋白質 ,  トランスクリプトーム解析 ,  組織特異的発現 ,  生物発生 ,  分子系統解析 ,  遺伝子構造 ,  分子系統樹 ,  Ziziphus jujuba(Dongzao)

分類 (2件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： Ziziphus ,  ボックス ,  遺伝子ファミリー ,  ゲノム ,  発現プロファイル