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J-GLOBAL ID：201702246466942535   整理番号：17A1558943

cDNAマイクロアレイ画像の完全自動格子のための形状に依存したアルゴリズム【Powered by NICT】

A shape-independent algorithm for fully-automated gridding of cDNA microarray images

著者 (3件)： Saberkari Hamidreza (Department of Electrical Engineering, Sahand University of Technology, Tabriz, Iran) ,  Shamsi Mousa (Department of Electrical Engineering, Sahand University of Technology, Tabriz, Iran) ,  Ghavifekr Habib Badri (Department of Electrical Engineering, Sahand University of Technology, Tabriz, Iran)
資料名： Computers and Electrical Engineering  (Computers and Electrical Engineering)
巻： 62  ページ： 135-150  発行年： 2017年 
JST資料番号： D0546B  ISSN： 0045-7906  CODEN： CPEEBQ  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本論文では,完全自動化マイクロアレイ格子アルゴリズムを提案した。このアルゴリズムは,可変長ブラックマン窓を用いた画像のブロック所見,Otsuしきい値処理法に基づく画像コントラスト強調,8連結標識法によりスポットとアーチファクトを含む画像オブジェクトの同定を含んでいる。さらに,各物体の画素の面積に基づいた形状に依存しないアルゴリズムは,ノイズ除去のために提案した。最終格子を構築スポットマトリックスに基づく新しい方法を用いて実行し,精密化法は,すべての可能性のあるグリッドライン誤差を最小にするために利用した。提案したアルゴリズムの性能を,スイスの研究所バイオインフォマティクス(SIB),Joe DeRisiの個々のtiffファイル(DeRisi),カリフォルニア大学サンフランシスコ校(UCSF),遺伝子発現オムニバス(GEO),Stanford Microarray Database(SMD)を含む五の公共データ集合で評価した。得られた結果は,提案したアルゴリズムがその他の最先端レベル手法と比較して,スポットの形状に関する雑音,アーチファクト,と不規則性のようなマイクロアレイ画像におけるいくつかの制限に対する精度と安定性のより高いレベルに達することを明らかにした。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *アルゴリズム ,  カリフォルニア州 ,  標識法 ,  *画像 ,  雑音 ,  精密化 ,  アーチファクト ,  遺伝子発現 ,  画素
準シソーラス用語： 不規則性 ,  バイオインフォマティクス ,  画像コントラスト ,  閾値処理 ,  *マイクロアレイ ,  *cDNAマイクロアレイ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： マイクロアレイ ,  格子化 ,  大津のしきい値処理 ,  雑音除去 ,  画像処理

分類 (5件)： ディジタル計算機方式一般  (JC02010O) ,  論理回路  (NC05070B) ,  計算機網  (JC03000K) ,  計算理論  (JB02000A) ,  CAD,CAM  (JE10000A)

タイトルに関連する用語 (3件)： cDNAマイクロアレイ ,  格子 ,  アルゴリズム