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J-GLOBAL ID：201702246825630138   整理番号：17A1500210

Cryptococcus laurentii株RY1からのキチン脱アセチル化酵素の触媒ドメインのホモロジーモデリング,分子ドッキングおよび分子動力学研究【Powered by NICT】

Homology modeling, molecular docking and molecular dynamics studies of the catalytic domain of chitin deacetylase from Cryptococcus laurentii strain RY1

著者 (5件)： Sarkar Soumyadev (Department of Life Science & Biotechnology, Jadavpur University, India) ,  Gupta Suchetana (Department of Biotechnology, Bhupat and Jyoti Mehta School of Biosciences, Indian Institute of Technology Madras, India) ,  Chakraborty Writachit (Department of Life Science & Biotechnology, Jadavpur University, India) ,  Senapati Sanjib (Department of Biotechnology, Bhupat and Jyoti Mehta School of Biosciences, Indian Institute of Technology Madras, India) ,  Gachhui Ratan (Department of Life Science & Biotechnology, Jadavpur University, India)
資料名： International Journal of Biological Macromolecules  (International Journal of Biological Macromolecules)
巻： 104  号： PB  ページ： 1682-1691  発行年： 2017年 
JST資料番号： T0898A  ISSN： 0141-8130  CODEN： IJBMDR  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： キチンデアセチラーゼへの構造的洞察を提供し,Cryptococcus laurentii歪RY1における窒素制限条件下で過剰発現する。酵素は二番目に多い天然生体高分子,キチンをキトサン,多様な分野での大きな応用を提供した。この生物学的および工業的に重要な酵素の構造-機能関係を明らかにするために,触媒ドメインの相同性モデルを構築した。構造の安定性を,分子動力学シミュレーション研究により評価した。ドメインのトリプトファン151はドッキングにキチンとの水素結合とスタッキング相互作用を形成することを見出した。トリプトファン(W)のin silico置換アラニン(A)では,フェニルアラニン(F)とアスパラギン酸(D)は,基板との相互作用におけるトリプトファン残基の重要性を確証した。はCryptococcusからのキチン脱アセチル化酵素の構造特性の解明の最初の報告であり,その基質に対する酵素のアプローチの理解。著者らの結果は,実験的検証を行い,詳細な触媒機構を決定するために量子力学/分子力学技術適用と酵素の工業的能力を向上させるために役立つであろう。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *脱アセチル ,  基質 ,  *酵素 ,  水素結合 ,  *分子動力学 ,  *Cryptococcus ,  キトサン ,  *キチン ,  相同性 ,  相互作用
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  キチンデアセチラーゼ ,  *分子ドッキング ,  *触媒ドメイン ,  *Cryptococcus laurentii , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： キチン脱アセチル化酵素 ,  Cryptococcus laurentii株RY1 ,  分子動力学

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (10件)： Cryptococcus ,  株 ,  キチン ,  脱アセチル化 ,  酵素 ,  触媒ドメイン ,  ホモロジーモデリング ,  分子ドッキング ,  分子動力学 ,  研究