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J-GLOBAL ID:201702247049437503   整理番号:17A0109860

上海白ブタ(上系)の遺伝的多様性と集団構造解析【JST・京大機械翻訳】

Genetic Diversity and Population Structure Analysis of Shanghai White Pig (Sus scrofa)
著者 (6件):
資料名:
巻: 24  号:ページ: 1293-1301  発行年: 2016年 
JST資料番号: C2715A  ISSN: 1674-7968  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: 中国 (CHN)  言語: 中国語 (ZH)
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上海白豚(上系)(SUS SCROFA)は上海市Min行区市の地方栽培品種であり、近年、品種の衝撃を導入することにより、その各生産指標が深刻に衰退し、しかもその遺伝資源特性、遺伝基礎及び交雑性能などについての理解が欠けている。本研究は全ゲノム範囲内の遺伝標識を応用し、上海白豚(上系)の個体群に対して遺伝的多様性と集団構造の分析を行った。まず、個体群内の遺伝的多様性を反映する3つの重要な指標-対立遺伝子の豊度(ALLELIC RICHNESS、A_R)、マーカー多型の割合(PID OF POLYMORPHIC MARKERS,P_N)と期待ヘテロ接合性(EXPECTED HETEROZYGOSITY,H_E)について分析と計算を行った。その結果,上海の白ブタ(上系)は遺伝的多様性が最も高く(P_N=0.731,A_R=放,H_E=0.221)であることを示した。上海の白ブタ(上系)と太湖品種間の遺伝的分化度(0.237±0.007)は,それらの遺伝的分化度(0.219±0.008)よりも大きかった。また,主成分分析(PRINCIPAL COMPONENTS ANALYSIS, PCA),STRUCTUREと系統樹などを用いて集団構造を解析した。結果により、上海白豚(上系)の個体群内の遺伝的多様性は、太湖のブタと西洋のブタより高いことが分かった。個体群間の遺伝的距離は,上海のブタ(上系%)が太湖のそれよりも西側のブタに近いことを示した。主成分分析,クラスタ分析および集団構造解析により,上海白ブタ(上系)が独立したグループを形成できることを示した。以上の結果から,分子レベルで見ると,上海白ブタ(上系)は独立した育成品種として合理的であり,特にその独特の遺伝構造を持ち,さらにその保護,開発と利用を強化すべきである。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】
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遺伝子の構造と化学  ,  作物の品種 

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