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J-GLOBAL ID：201702247292407433   整理番号：17A1518682

上海市浦東新区における麻薬注射者のHCVの進化分析と正選択サイトの研究【JST・京大機械翻訳】

Evolutionary characteristics and positive selection site of hepatitis C virus isolated in intravenous drug users in Pudong new district, Shanghai

著者 (7件)： Wang Yu (200032上海,復旦大学公共衛生学院,公共衛生安全教育部重点実験室) ,  Wu Hongyan (200120 上海市浦東新区疾病預防控制中心;200120上海,復旦大学浦東預防医学研究院) ,  Zhao Xichang (200120 上海市浦東新区疾病預防控制中心;200120上海,復旦大学浦東預防医学研究院) ,  Zhu Weiping (200120 上海市浦東新区疾病預防控制中心;200120上海,復旦大学浦東預防医学研究院) ,  Wan Qian (200120 上海市浦東新区疾病預防控制中心;200120上海,復旦大学浦東預防医学研究院) ,  Lu Yihan (200032上海,復旦大学公共衛生学院,公共衛生安全教育部重点実験室;200120上海,復旦大学浦東預防医学研究院) ,  Jiang Qingwu (200032上海,復旦大学公共衛生学院,公共衛生安全教育部重点実験室)
資料名： Zhonghua Liuxingbingxue Zazhi  (Zhonghua Liuxingbingxue Zazhi)
巻： 38  号： 3  ページ： 378-383  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2330A  ISSN： 0254-6450  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:上海市浦東新区注射麻薬により分離されたHCVの遺伝子タイピングを理解し、そのウイルス個体群の成長進化過程と選択圧力を分析する。【方法】HCV NS5B377-ntのヌクレオチド断片を,200人の患者におけるメタドンの注射によって,200人の健常者から採取した。200人の患者において増幅した(HCV NS5B377-nt)。同時期現地のボランティア献血者、MSM、法定法によりC型ウイルス性肝炎(C型肝炎)症例の分離配列を報告し、BEASTソフトウェアパッケージを用いて、主な遺伝子型の進化速度と個体群の進化過程を分析した。Datamonkeyオンラインソフトウェアパッケージを用いて、注射麻薬の分離配列を分析し、選択圧を分析し、直接抗ウイルス薬(Direct-acting antiviral,DAA)の結合部位と比較した。【結果】HCVRNAの陽性検出率は19.5%(39/200)であり,遺伝子型は3aサブタイプ(14),3bサブタイプ(13),1bサブタイプ(7),6aサブタイプ(4),6nサブタイプ(1)であった。注射された麻薬の分離株は,他の群と比較して,高い相同性を示した。進化分析により、HCV 1b亜型の理論感染人数は20世紀90年代から増加し、増加速度は速く、3aと3b亜型は90年代中期から次第に上昇する傾向があることが明らかになった。選択した圧力分析により、注射麻薬のNS5B377-nt断片には2つの正選択部位が認められ、7つのDAA結合部位の突然変異率は2.2%であることが分かった。結論 HCV 3aと3b亜型は上海浦東注射麻薬中毒者におけるC型肝炎感染の主導遺伝子型であることが示唆された。一方、1bサブタイプは各集団において普遍的に分布し、進化率は比較的に速く、それによる感染数は持続的に上昇する。注射したHCV NS5B遺伝子断片のDAA結合部位の突然変異率が低く、薬物結合効果が良いことが予想された。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 感染 ,  プログラムパッケージ ,  抗ウイルス薬 ,  ウイルス ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  患者 ,  *麻薬 ,  結合部位 ,  個体群 ,  相同性
準シソーラス用語： NS5B ,  サブタイプ ,  選択圧 ,  *注射 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Hepatitis C virus ,  Genotype ,  Evolutionary analysis ,  Positive selection site

分類 (3件)： 土地利用一般,地域制  (RD02010Z) ,  公園,造園,緑化  (RD04020Y) ,  商業建築,事務所建築  (RB05030K)

タイトルに関連する用語 (7件)： 上海 ,  麻薬 ,  注射 ,  HCV ,  進化 ,  分析 ,  研究