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J-GLOBAL ID：201702247541770229   整理番号：17A0221690

原発性硬化性胆管炎のゲノムワイド関連研究を行い,新たなリスク座位を同定し,炎症性腸疾患との遺伝的類似性を数値化した

Genome-wide association study of primary sclerosing cholangitis identifies new risk loci and quantifies the genetic relationship with inflammatory bowel disease

著者 (83件)： JI Sun-Gou (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR) ,  KUMASAKA Natsuhiko (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR) ,  LIU Jimmy Z (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR) ,  SHAH Tejas (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR) ,  GUTIERREZ-ACHURY Javier (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR) ,  OUWEHAND Willem H (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR) ,  DANESH John (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR) ,  GAFFNEY Daniel J (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR) ,  ANDERSON Carl A (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR) ,  JURAN Brian D (Mayo Clinic Coll. of Medicine, Minnesota, USA) ,  SCHLICHT Erik M (Mayo Clinic Coll. of Medicine, Minnesota, USA) ,  GULAMHUSEIN Aliya F (Mayo Clinic Coll. of Medicine, Minnesota, USA) ,  EATON John E (Mayo Clinic Coll. of Medicine, Minnesota, USA) ,  LAZARIDIS Konstantinos N (Mayo Clinic Coll. of Medicine, Minnesota, USA) ,  MUCHA Soeren (Christian Albrechts Univ. Kiel, Kiel, DEU) ,  ELLINGHAUS David (Christian Albrechts Univ. Kiel, Kiel, DEU) ,  SCHREIBER Stefan (Christian Albrechts Univ. Kiel, Kiel, DEU) ,  FRANKE Andre (Christian Albrechts Univ. Kiel, Kiel, DEU) ,  FOLSERAAS Trine (Oslo Univ. Hospital, Oslo, NOR) ,  MELUM Espen (Oslo Univ. Hospital, Oslo, NOR) ,  BOBERG Kirsten M (Oslo Univ. Hospital, Oslo, NOR) ,  KARLSEN Tom H (Oslo Univ. Hospital, Oslo, NOR) ,  FOLSERAAS Trine (Univ. Oslo, Oslo, NOR) ,  BOBERG Kirsten M (Univ. Oslo, Oslo, NOR) ,  KARLSEN Tom H (Univ. Oslo, Oslo, NOR) ,  JOSTINS Luke (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  ATKINSON Elizabeth J (Mayo Clinic, Minnesota, USA) ,  DE ANDRADE Mariza (Mayo Clinic, Minnesota, USA) ,  BERGQUIST Annika (Karolinska Institutet, Stockholm, SWE) ,  VERMEIRE Severine (Katholieke Universiteit Leuven, Leuven, BEL) ,  VERMEIRE Severine (Univ. Hospital Leuven, Leuven, BEL) ,  EKSTEEN Bertus (Univ. Calgary, Alberta, CAN) ,  DURIE Peter R (Hospital for Sick Children, Ontario, CAN) ,  FARKKILA Martti (Helsinki Univ., Helsinki, FIN) ,  MUELLER Tobias (Charite Universitaetsmedizin Berlin, Berlin, DEU) ,  SCHRAMM Christoph (Univ. Medical Center Hamburg-Eppendorf, Hamburg, DEU) ,  STERNECK Martina (Univ. Medical Center Hamburg-Eppendorf, Hamburg, DEU) ,  WEISMUELLER Tobias J (Hannover Medical School, Hannover, DEU) ,  MANNS Michael P (Hannover Medical School, Hannover, DEU) ,  WEISMUELLER Tobias J (Univ. Hospital of Bonn, Bonn, DEU) ,  GOTTHARDT Daniel N (Univ. Hospital of Heidelberg, Heidelberg, DEU) ,  BRAUN Felix (Univ. Medical Centre Schleswig-Holstein, Kiel, DEU) ,  TEUFEL Andreas (Univ. Medical Center, Regensburg, DEU) ,  LAUDES Mattias (Univ. Medical Centre Schleswig-Holstein, Kiel, DEU) ,  LIEB Wolfgang (Univ. Medical Centre Schleswig-Holstein, Kiel, DEU) ,  JACOBS Gunnar (Univ. Medical Centre Schleswig-Holstein, Kiel, DEU) ,  BEUERS Ulrich (Univ. Amsterdam, Amsterdam, NLD) ,  WEERSMA Rinse K (Univ. Medical Centre Groningen, Groningen, NLD) ,  WIJMENGA Cisca (Univ. Medical Centre Groningen, Groningen, NLD) ,  MARSCHALL Hanns-Ulrich (Univ. Gothenburg, Gothenburg, SWE) ,  MILKIEWICZ Piotr (Medical Univ. Warsaw, Warsaw, POL) ,  PARES Albert (Univ. Barcelona, Barcelona, ESP) ,  KONTULA Kimmo (Univ. Helsinki, Helsinki, FIN) ,  CHAZOUILLERES Olivier (UPMC Univ. Paris 6, Paris, FRA) ,  INVERNIZZI Pietro (Humanitas Clinical and Res. Center, Milan, ITA) ,  GOODE Elizabeth (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  SPIESS Kelly (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  SRIVASTAVA Brijesh (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  MELLS George (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  SANDFORD Richard N (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  RUSHBROOK Simon M (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  MOORE Carmel (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  OUWEHAND Willem H (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  ROBERTS David J (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  DANESH John (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  SAMBROOK Jennifer (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  OUWEHAND Willem H (NHS Blood and Transplant, Cambridge, GBR) ,  ROBERTS David J (John Radcliffe Hospital, Oxford, GBR) ,  ROBERTS David J (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  FLOREANI Annarosa (Univ. Padova, Padova, ITA) ,  SCHREIBER Stefan (Univ. Hospital Schleswig-Holstein Campus Kiel, Kiel, DEU) ,  COLTESCU Catalina (Toronto Western Hospital, Ontario, CAN) ,  BOWLUS Christopher L (Univ. California at Davis, California, USA) ,  LUKETIC Velimir A (Virginia Commonwealth Univ., Virginia, USA) ,  ODIN Joseph A (Mount Sinai School of Medicine, New York, USA) ,  CHOPRA Kapil B (Univ. Pittsburgh, Pennsylvania, USA) ,  KOWDLEY Kris V (Swedish Medical Center, Washington, USA) ,  CHALASANI Naga (Indiana Univ. School of Medicine, Indiana, USA) ,  MELLS George (Addenbrooke’s Hospital, Cambridge, GBR) ,  ALEXANDER Graeme (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  CHAPMAN Roger W (Oxford Univ. Hospitals NHS Trust, Oxford, GBR) ,  HIRSCHFIELD Gideon M (Univ. Birmingham, Birmingham, GBR) ,  HIRSCHFIELD Gideon M (Toronto Western Hospital, Ontario, CAN)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 49  号： 2  ページ： 269-273  発行年： 2017年02月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 原発性硬化性胆管炎(PSC)は胆管狭窄を生じる稀な進行性の疾患であり,PSC患者のおよそ75%は合併症として炎症性腸疾患(IBD)を発症している。今回,PSCについての最大規模のゲノムワイド関連解析(患者4,796人および対照集団19,955人)を行い,ゲノムワイドな有意性を示す,4つの新たな座位を同定した。ある座位で最も強く関連を示すSNPは,UBASH3Aのスプライシングや発現に影響を及ぼすことが分かり,“防御効果“のある対立遺伝子(C)がUBASH3AのノンストップmRNA分解や低発現を引き起こすと予測される。高頻度バリアントについてさらに解析を進めたところ,PSCと潰瘍性大腸炎(UC)とのゲノムワイド相関(r_G)のほうが(r_G=0.29),PSCとクローン病とのそれ(r_G=0.04)をはるかに上回ることが示された(P=2.55×10^-15)。UCとCDは遺伝的に類似しており(r_G=0.56),それは,それぞれのPSCとの類似性よりも高かった(P<1.0×10^-15)。今回の研究成果は,PSCの遺伝基盤を解明する上で大きな進展をもたらすものである。Copyright Nature Japan KK 2017

シソーラス用語： *胆管炎 ,  ゲノムワイド関連解析 ,  *リスク ,  *炎症 ,  腸疾患 ,  ヒト ,  遺伝子座 ,  一塩基多型 ,  遺伝子 ,  遺伝子発現
準シソーラス用語： UBASH3A遺伝子 ,  *遺伝的リスク ,  *炎症性腸疾患 ,  *原発性硬化性胆管炎

分類 (3件)： 遺伝的変異  (EC01030Y) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  消化器の基礎医学  (GH01020E)

タイトルに関連する用語 (9件)： 原発性硬化性胆管炎 ,  ゲノム ,  研究 ,  リスク ,  座位 ,  同定 ,  炎症性腸疾患 ,  遺伝的類似性 ,  数値化