表現型マイクロアレイによるHelicobacter pyloriJ99とマレーシアの臨床株の代謝ネットワークの解明【Powered by NICT】

Lee Woon Ching; Goh Khean Lee; Loke Mun Fai; Vadivelu Jamuna

文献

J-GLOBAL ID：201702248340962580 整理番号：17A1116895

表現型マイクロアレイによるHelicobacter pyloriJ99とマレーシアの臨床株の代謝ネットワークの解明【Powered by NICT】

Elucidation of the Metabolic Network of Helicobacter pylori J99 and Malaysian Clinical Strains by Phenotype Microarray

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資料名：
巻： 22 号： 1 ページ： null 発行年： 2017年
JST資料番号： W2595A ISSN： 1083-4389 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

背景:Helicobacter pyloriは世界人口のほぼ半分にコロニーを形成する。H.pylori株は遺伝的に多様で,特異的遺伝子型は胃腺癌,消化性潰よう病(PUD),および非潰瘍性消化不良(NUD)を含む多彩な臨床症状と関連している。しかし,H.pylori代謝に関する著者らの現在の知識は限られている。H.pylori株の間の代謝の違いを理解するために,マレーシアの四H.pylori臨床分離株,以前に配列決定された,および表現型レベルで標準株,H.pylori J99,を検討した。材料と方法H.pylori株の表現型はゲノムデータを裏付けるためにBiolog表現型マイクロアレイシステムを用いて解析した。KEGGデータベースからH.pyloriゲノムデータからの炭素と窒素代謝経路を予測することにより分析を開始した。Biolog PMは,予測の検証を助け,H.pylori phenomesのより集中的な解析を提供した。【結果】我々は試験したすべての株によって利用された代謝栄養源のコアセットと局所歪だけで差別的に利用した別のセットを同定した。ペントース糖はH.pyloriにより利用される好ましい炭素栄養素である。アミノ酸L-アスパラギン酸,D-アラニン,L-アスパラギンは細菌の代謝における炭素と窒素源として機能する。【結論】本研究に基づく表現型プロファイルは,その自然宿主におけるH.pyloriの生存に関してより良い理解を提供する。著者らのデータは,H.pyloriの系統間の代謝の違いを相関させることにおける将来の挑戦のための基礎として役立つ。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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感染症・寄生虫症一般 , 微生物検査 , 微生物感染の生理と病原性 , 微生物検査法 , 遺伝子の構造と化学

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