Aligator:大きな蛋白質の全化学合成を最適化するための計算ツール【Powered by NICT】

Jacobsen Michael T.; Erickson Patrick W.; Kay Michael S.

文献

J-GLOBAL ID：201702248924274585 整理番号：17A1158580

Aligator:大きな蛋白質の全化学合成を最適化するための計算ツール【Powered by NICT】

Aligator: A computational tool for optimizing total chemical synthesis of large proteins

出版者サイト複写サービスで全文入手 {{ this.onShowCLink("http://jdream3.com/copy/?sid=JGLOBAL&noSystem=1&documentNoArray=17A1158580&COPY=1") }}
高度な検索・分析はJDreamⅢで {{ this.onShowJLink("http://jdream3.com/lp/jglobal/index.html?docNo=17A1158580&from=J-GLOBAL&jstjournalNo=W0556A") }}

著者 (3件)： , ,
資料名：
巻： 25 号： 18 ページ： 4946-4952 発行年： 2017年
JST資料番号： W0556A ISSN： 0968-0896 資料種別：逐次刊行物 (A)
発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

化学蛋白質合成(CPS)の範囲が拡大し,主に化学連結ツール(例えば,可逆的可溶化基と新しい連結化学)の進歩により駆動され続けている。しかし,最適合成経路の設計は理論的に可能で,多くの場合における問題のある合成戦略の大きな数のために困難とfickle作業である。この観点から,筆者らは,最近のCPSツールの進歩に焦点を当て,次にCPSを用いた大きなターゲットを構築するための最も効率的な戦略の解析と設計のための,Aligator(自動Ligator),新しい使い易いプログラムを導入した。モデルセットとして,E.coliリボソーム蛋白質と計算機解析のための関連因子を選択した。Aligatorを系統的にスコア,特にCPS標的のためのすべての実現可能な合成戦略をランク付けした。Aligatorスクリプトは,潜在的な合成戦略のランク付きリストを提供するために溶解度,結さつ部位品質,セグメント長さ,および連結の数を含むスコアリング関数を用いた標的の可能性ペプチドセグメントを評価する方法論的に。は著者らの研究室からの最近の三CPSプロジェクトを解析することによりAligatorの有用性を実証した:TNFα(157aa),GroES(97aa),DapA(312aa)。CPSの限界は拡張したとして,計算ツールが鏡像リボソームの生産のような野心的なCPSプロジェクトの効率的実施においてますます重要な役割を果たすであろうことを期待する。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

, , , ,

前のページに戻る