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J-GLOBAL ID:201702248956437885   整理番号:17A1830450

増幅断片長多型データからの倍数体の起源を推定するための新しい方法は生息するSenecio carniolicus(キク科)の高山性倍数複合体は同質倍数性によるを中心とした進化したことを明らかにする【Powered by NICT】

A novel method to infer the origin of polyploids from Amplified Fragment Length Polymorphism data reveals that the alpine polyploid complex of Senecio carniolicus (Asteraceae) evolved mainly via autopolyploidy
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資料名:
巻: 17  号:ページ: 877-892  発行年: 2017年 
JST資料番号: W2685A  ISSN: 1755-098X  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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その進化的および生態学的関連性にもかかわらず,倍数体起源のモードは分子データから再構成することは著しく困難である。,倍数体の推定上の両親を同定するために,増幅断片長多型(AFLP)データからのそれらの起源(自己対異質倍数性)のモードを推定する方法を示した。この目的のために,Cohenのd in silico倍数体間の距離,事前限定推定親エンティティ(例えば分類群,遺伝系統),自然倍数体からの起源の事前定義されたシナリオ内で発生するのを用いた。シミュレーションは,提案した方法の識別力は主に低倍数性推定祖先間の分岐の増加及び発散の時間に関連した倍数体化の遅延の増加を伴って,増加することを示した。Senecio carniolicus凝集体への新しい方法,ヨーロッパアルプスに分布し,二倍体,一つの四倍体と六倍体種を適用した。分布の東部では,S.carniolicus凝集体は同質倍数体シリーズから構成されていると推定されたが,四倍体種の西洋人集団では,二倍体種を含む異質倍数体起源が最も考えやすいシナリオであった。これは四倍体種は二個の独立した起源を持つことを示唆するが,他の証拠(リボタイプ分布,形態)は第二の二倍体種による遺伝子移入による同質倍数体起源の仮説と一致した。まとめると,Cohenのdを用いて代替シナリオの中で最良の結果を特定なものとなるが,異質倍数体起源同質倍数体起源その後の遺伝子移入と対のような特定のシナリオは区別することは困難である。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】
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分子遺伝学一般  ,  進化論一般 
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