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J-GLOBAL ID：201702249392897704   整理番号：17A1550245

マクロファージ開発中の静的および動的DNAループAP1結合活性化ハブを形成する【Powered by NICT】

Static and Dynamic DNA Loops form AP-1-Bound Activation Hubs during Macrophage Development

著者 (19件)： Phanstiel Douglas H. (Department of Cell Biology and Physiology, University of North Carolina, Chapel Hill, NC 27599, USA) ,  Phanstiel Douglas H. (Thurston Arthritis Research Center, University of North Carolina, Chapel Hill, NC 27599, USA) ,  Phanstiel Douglas H. (Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Van Bortle Kevin (Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Spacek Damek (Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Hess Gaelen T. (Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Shamim Muhammad Saad (The Center for Genome Architecture, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA) ,  Shamim Muhammad Saad (Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA) ,  Shamim Muhammad Saad (Department of Computer Science and Department of Computational and Applied Mathematics, Rice University, Houston, TX 77005, USA) ,  Machol Ido (The Center for Genome Architecture, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA) ,  Machol Ido (Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA) ,  Machol Ido (Department of Computer Science and Department of Computational and Applied Mathematics, Rice University, Houston, TX 77005, USA) ,  Love Michael I. (Department of Biostatistics, University of North Carolina, Chapel Hill, NC 27599, USA) ,  Love Michael I. (Department of Genetics, University of North Carolina, Chapel Hill, NC 27599, USA) ,  Aiden Erez Lieberman (The Center for Genome Architecture, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA) ,  Aiden Erez Lieberman (Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA) ,  Aiden Erez Lieberman (Department of Computer Science and Department of Computational and Applied Mathematics, Rice University, Houston, TX 77005, USA) ,  Bassik Michael C. (Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA) ,  Snyder Michael P. (Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA)
資料名： Molecular Cell  (Molecular Cell)
巻： 67  号： 6  ページ： 1037-1048.e6  発行年： 2017年 
JST資料番号： W1167A  ISSN： 1097-2765  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒトゲノムの三次元配置は,ヒト発達中に転写の変化協調のための重要な構造的および調節クロマチンループの複雑なネットワークで構成されている。細胞分化の間の状況特異的3Dクロマチン構造と転写の基礎となる機構をより良く理解するために,著者らはヒト単球と分化したマクロファージにおけるDNAループの包括的なin situ Hi-Cマップを生成した。動的ループ事象は本質的に構造よりもむしろ調節と予め形成されたおよび後天性DNAループにおける動的エンハンサー活性の広範な配位を明らかにすることを示した。予備形成されたループのエンハンサー結合ループ形成とエンハンサ活性化は,重要なマクロファージ遺伝子における多重ループ活性化ハブを形成する。活性化ハブはプロモーター当たり3.4エンハンサーを結合し,活性化因子蛋白質1(AP 1)結合イベントの強い濃縮を示し,細胞型特異的転写因子を含む多重ループ活性化ハブは転写の空間的および時間的制御のための調節クロマチン構造の重要なクラスを表すことを示唆した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *AP-1因子 ,  プロモーター領域 ,  ヒト ,  タンパク質 ,  ネットワーク ,  *マクロファージ ,  転写因子 ,  細胞分化 ,  *DNA【核酸】 ,  多重化
準シソーラス用語： 細胞型 ,  ヒト単球 ,  クロマチン構造 ,  ヒトゲノム ,  *結合活性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： CTCF ,  AP-1 ,  Hi-C ,  DNAループ形成 ,  細胞分化

分類 (2件)： 生物学的機能  (EB03040U) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (7件)： マクロファージ ,  開発 ,  DNA ,  ループ ,  AP1 ,  結合活性 ,  ハブ