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J-GLOBAL ID：201702249837135827   整理番号：17A1830455

マーカー発見のための植物ミトコンドリアゲノムの再構築:Pinusを用いた事例研究【Powered by NICT】

Reconstructing the plant mitochondrial genome for marker discovery: a case study using Pinus

著者 (11件)： Donnelly Kevin (NERC Centre for Ecology and Hydrology, Edinburgh, Bush Estate, Penicuik, Midlothian, EH26 0QB, UK) ,  Donnelly Kevin (Institute of Evolutionary Biology, School of Biological Sciences, Ashworth Laboratories, University of Edinburgh, Edinburgh, EH9 3JT, UK) ,  Cottrell Joan (Forest Research, Northern Research Station, Roslin, Midlothian, EH25 9SY, UK) ,  Ennos Richard A. (Institute of Evolutionary Biology, School of Biological Sciences, Ashworth Laboratories, University of Edinburgh, Edinburgh, EH9 3JT, UK) ,  Vendramin Giovanni Giuseppe (Institute of Biosciences and BioResources, Division of Florence, National Research Council, Via Madonna del Piano, 10, 50019, Sesto Fiorentino (Firenze), Italy) ,  A’Hara Stuart (Forest Research, Northern Research Station, Roslin, Midlothian, EH25 9SY, UK) ,  King Sarah (NERC Centre for Ecology and Hydrology, Edinburgh, Bush Estate, Penicuik, Midlothian, EH26 0QB, UK) ,  Perry Annika (NERC Centre for Ecology and Hydrology, Edinburgh, Bush Estate, Penicuik, Midlothian, EH26 0QB, UK) ,  Wachowiak Witold (NERC Centre for Ecology and Hydrology, Edinburgh, Bush Estate, Penicuik, Midlothian, EH26 0QB, UK) ,  Wachowiak Witold (Institute of Dendrology, Polish Academy of Sciences, Parkowa 5, 62-035, Kornik, Poland) ,  Cavers Stephen (NERC Centre for Ecology and Hydrology, Edinburgh, Bush Estate, Penicuik, Midlothian, EH26 0QB, UK)
資料名： Molecular Ecology Resources  (Molecular Ecology Resources)
巻： 17  号： 5  ページ： 943-954  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2685A  ISSN： 1755-098X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 全ゲノムDNAの全ゲノムショットガン(WGS)配列決定を用いて,Pinus sylvestris(L.)由来の新規ミトコンドリア(mtDNA)配列の約1Mbpと密接に関連したPinus mugo種複合体の三メンバーを回収した。DNAは全欧州の様々な場所から六母樹からの大配偶体組織から抽出し,100bpペアエンドシーケンシングはIllumina社のHiSeqプラットホームで実行された。候補mtDNA配列は,それらのサイズと被覆率特性,公表された植物ミトコンドリアゲノムとの比較により同定した。新規変異体を同定し,これらの遺伝子座を標的とするプライマーはヨーロッパからの28個体の集合上で試験した。全体で,31のSNP遺伝子座を成功裏に再配列,15のユニークなハプロタイプを特性化した。この手法は参照配列が入手できない他の植物種におけるミトコンドリアゲノムのマーカー資源開発の費用対効果に優れた手段を提供する。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 資源開発 ,  ハプロタイプ ,  キャラクタリゼーション ,  *再構成 ,  *ミトコンドリア ,  被覆率 ,  *事例研究 ,  ヨーロッパ ,  複合体 ,  DNA【核酸】
準シソーラス用語： 費用対効果 ,  母樹 ,  ミトコンドリアDNA ,  ゲノムDNA ,  *ミトコンドリアゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ハイスループット配列決定 ,  マーカーの発見 ,  ミトコンドリア ,  系統地理学 ,  Pinus

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (7件)： マーカー ,  発見 ,  植物 ,  ミトコンドリアゲノム ,  再構築 ,  Pinus ,  研究