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J-GLOBAL ID：201702250155879198   整理番号：17A1178541

タマキビガイの3種の比較ミトゲノム解析:Littorina fabalis,L.obtusataとL.saxatilis【Powered by NICT】

Comparative mitogenomic analysis of three species of periwinkles: Littorina fabalis, L. obtusata and L. saxatilis

著者 (7件)： Marques Joao P. (CIBIO, Centro de Investigacao em Biodiversidade e Recursos Geneticos, InBIO, Laboratorio Associado, Universidade do Porto, Campus Agrario de Vairao, 4485-661 Vairao, Portugal) ,  Sotelo Graciela (CIBIO, Centro de Investigacao em Biodiversidade e Recursos Geneticos, InBIO, Laboratorio Associado, Universidade do Porto, Campus Agrario de Vairao, 4485-661 Vairao, Portugal) ,  Larsson Tomas (University of Gothenburg, Department of Marine Sciences, Box 460, SE -405 30 Gothenburg, Sweden) ,  Johannesson Kerstin (University of Gothenburg, Department of Marine Sciences, Tjaerno, SE -452 96 Stromstad, Sweden) ,  Panova Marina (University of Gothenburg, Department of Marine Sciences, Tjaerno, SE -452 96 Stromstad, Sweden) ,  Faria Rui (CIBIO, Centro de Investigacao em Biodiversidade e Recursos Geneticos, InBIO, Laboratorio Associado, Universidade do Porto, Campus Agrario de Vairao, 4485-661 Vairao, Portugal) ,  Faria Rui (IBE, Institute of Evolutionary Biology (CSIC-UPF), Department of Experimental and Health Sciences, Pompeu Fabra University, Doctor Aiguader 88, 08003 Barcelona, Spain)
資料名： Marine Genomics  (Marine Genomics)
巻： 32  ページ： 41-47  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3299A  ISSN： 1874-7787  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Littorina fabalisおよびL.obtusata,平坦タマキビガイは局所適応と生態学的種分化研究のための興味深い系を提供する。これらの種のゲノム資源を提供するために,著者らは次世代配列決定技術によって粗いニチニチソウ.saxatilisのそれと一緒にそれらのミトゲノムの配列を決定した。三ミトゲノムは13の蛋白質コード遺伝子,tRNA遺伝子22個,リボソームRNA遺伝子二と推定制御領域の典型的なレパートリーを提示した。後者は高度反復フラグメントによる短リードを用いたフラットタマキビガイにおける完全に回復できなかったが,L.saxatilisにおけるこの問題であった付加的な長いリードと克服,完全ミトゲノムをまとめることができた。遺伝子順序とヌクレオチド組成の両方が三種間で類似しておりのみならず他のLittorinimorphaと比較した。発散における大きな変動はミトコンドリア領域を横切って観察され,最高と最低の発散速度の10倍差六であった。全分子と分子時計を仮定したヌクレオチド変化に基づき,L.fabalisおよびL.obtusataは約0.8Mya(0.4 1.1Mya)を発散し始めた。三Littorina種におけるミトコンドリア蛋白質コード遺伝子の進化は正の選択の証拠は検出されなかったことをD_/D_比に基づいた系統発生学的試験により明らかにされた主に純化淘汰に影響される,データセットと実装手法の限られた電力与えられた必要であるいくつかの注意。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： rRNA遺伝子 ,  種分化 ,  タンパク質 ,  淘汰 ,  生態学 ,  遺伝子 ,  ヌクレオチド ,  *ゲノム ,  ミトコンドリア ,  ニチニチソウ
準シソーラス用語： 分子時計 ,  遺伝子順序 ,  tRNA遺伝子 ,  *ゲノミクス ,  *タマキビガイ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： アノテーション ,  組立 ,  腹足綱 ,  mtDNA多様性 ,  選択

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  動物の生化学  (EJ01050P)

タイトルに関連する用語 (3件)： タマキビガイ ,  ゲノム解析 ,  Littorina