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J-GLOBAL ID：201702250301733405   整理番号：17A1520376

アマモamaAG遺伝子クローニングと生物情報学的解析【JST・京大機械翻訳】

Cloning and Bioinformatics Analysis of amaAG in Amaranthus tricolor L.

著者 (4件)： Liu Yan (福建農林大学 園芸植物生物工程研究所,福建 福州,350002) ,  Xie Liyang (福建農林大学 園芸植物生物工程研究所,福建 福州,350002) ,  Lai Zhongxiong (福建農林大学 園芸植物生物工程研究所,福建 福州,350002) ,  Liu Shengcai (福建農林大学 園芸植物生物工程研究所,福建 福州,350002)
資料名： Jiangxi Nongye Daxue Xuebao  (Jiangxi Nongye Daxue Xuebao)
巻： 39  号： 1  ページ： 168-174  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2944A  ISSN： 1000-2286  CODEN： JNXUEV  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： アマモの種子を初期材料とし、体外培養によりアマランスの各段階における試験管苗を得た。実験室で構築されたアマランサスの開花過程におけるトランスクリプトームデータベースを用いた(I SRA number:SRR924089,SSR924090,SRR924091,SRR924092)。RT-PCRとRACE技術を用いてamaAG遺伝子の全長cDNA配列をクローンし、それに対して生物情報学的分析を行った。結果により、アマランスamaAG遺伝子の全長は1123bpであり、そのうち5′UTR 122bp、3′UTR 243bp、poly A尾の長さは17bpで、741bpのオープンリーディングフレームを含み、246個のアミノ酸をコードすることが分かった。生物情報学の分析により、このタンパク質は親水性タンパク質に属するが、安定蛋白質ではないことが分かった。MADSとK-boxスーパーファミリーに属し、MADS_MEF2-likeとK-box機能部位が含まれ、植物開花と関係があり、amaAG遺伝子の差異発現分析により、この遺伝子は開花期に発現量が最も高いことが分かった。本研究により、アマランスamaAG遺伝子が得られたことが分かり、これは将来的にその機能を深く研究するために基礎を築き、アマランサスの開花の分子メカニズムの研究にも参考を提供することができる。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 開花 ,  アミノ酸 ,  RT-PCR法 ,  *遺伝子クローニング ,  クローン ,  タンパク質 ,  ヒユ属 ,  *遺伝子 ,  スルホン酸 ,  アゾ化合物 ,  フェノール類 ,  ナトリウム化合物 ,  芳香族縮合化合物
準シソーラス用語： 分子機構 ,  オープンリーディングフレーム ,  5′非翻訳領域 ,  cDNA配列 ,  *バイオインフォマティクス ,  *Zostera marina , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Amaranthus tricolor L. ,  amaAG ,  cloning ,  flower ,  bioinformatics

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (1件)： アマランス

タイトルに関連する用語 (4件)： アマモ ,  遺伝子クローニング ,  生物情報学 ,  解析