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J-GLOBAL ID：201702250936206542   整理番号：17A1575056

普通タバコのDREB転写因子の配列同定と発現分析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide Sequence Identification and Expression Analysis of DREB Transcription Factors in Nicotiana tabacum

著者 (7件)： Hu Junhua (中国農業科学院烟草研究所,烟草行業烟草基因資源利用重点実験室,青島266101;中国農業科学院研究生院,北京100081) ,  Wang Dawei (中国農業科学院烟草研究所,烟草行業烟草基因資源利用重点実験室,青島266101) ,  Yang Minglei (中国農業科学院烟草研究所,烟草行業烟草基因資源利用重点実験室,青島266101;中国農業科学院研究生院,北京100081) ,  Wang Xin (中国農業科学院烟草研究所,烟草行業烟草基因資源利用重点実験室,青島266101;中国農業科学院研究生院,北京100081) ,  Wu Xinru (中国農業科学院烟草研究所,烟草行業烟草基因資源利用重点実験室,青島266101) ,  Wu Hua (中国農業科学院烟草研究所,烟草行業烟草基因資源利用重点実験室,青島266101) ,  Liu Guanshan (中国農業科学院烟草研究所,烟草行業烟草基因資源利用重点実験室,青島266101)
資料名： Zhongguo Yancao Kexue  (Zhongguo Yancao Kexue)
巻： 38  号： 1  ページ： 1-7  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2787A  ISSN： 1007-5119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： DREB転写因子は保存されたAP2/ERFドメインを含み、植物のストレス耐性過程において重要な役割を果たしている。生物情報学の分析手段により、シロイヌナズナDREBファミリーのメンバー配列を参照とし、普通タバコ(Nicotiana tabacum)ゲノムの公共データベースから68個のDREB転写因子を同定した。タバコDREB転写因子ファミリーに対して、物理化学的性質、系統進化、保存構造域及び発現分析を行った。結果により、普通タバコのゲノムは68個のDREB転写因子ファミリーのメンバーをコードし、アミノ酸の数の差異は比較的大きいことが分かった。系統発生分析により、シロイヌナズナとタバコのDREB転写因子は125個のメンバーが6つの進化分枝を形成し、そのうちタバコはシロイヌナズナよりA6分枝を欠いていることが明らかになった。構造ドメイン分析により、同一の分枝内のDREB転写因子の保存ドメインとmotifは高度な一致性があることが明らかになった。組織発現の分析により、ほとんどのDREBファミリー遺伝子はタバコにおいて発現量が比較的低く、老化、干ばつ及び病害ストレス下で遺伝子発現量が多いことが明らかになった。この研究はタバコのDREB転写因子の更なる分析のために生物情報学の基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 類似性 ,  ゲノム ,  アミノ酸 ,  データベース ,  *たばこ ,  遺伝子発現 ,  遺伝子 ,  *転写因子 ,  Arabidopsis thaliana ,  干ばつ ,  系統発生
準シソーラス用語： 系統解析 ,  物理化学的性質 ,  バイオインフォマティクス ,  ストレス耐性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： DREB transcription factor ,  Nicotiana tabacum ,  bioinformatics ,  expression analysis

分類 (4件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物生理学一般  (EH02010Y) ,  植物に対する影響  (EE04030Z) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： タバコ ,  転写因子 ,  同定 ,  発現 ,  分析