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J-GLOBAL ID:201702250986482641   整理番号:17A1524918

乾湿交替により誘導されたイネ根の鉄膜形成の遺伝子発現プロファイルの解析【JST・京大機械翻訳】

Gene Expression Profile Analysis for Alternate Wetting and Drying Induced Formation of Iron Plaque on Root Surface of Rice Seedlings
著者 (4件):
資料名:
巻: 31  号:ページ: 133-148  発行年: 2017年 
JST資料番号: C2254A  ISSN: 1001-7216  CODEN: ZSKHBX  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: 中国 (CHN)  言語: 中国語 (ZH)
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[目的]乾湿交替(AWD)は水稲の栽培過程において最も重要な管理方式であり、水稲の根系の活力を高め、ストレス抵抗性を高めることができる。研究により、AWDは水稲根表面の鉄膜の形成を明らかに促進できることが分かった。しかし、AWDによる水稲根の鉄膜形成を誘導する遺伝子の発現スペクトルについてはまだ報告されていない。[方法]砂栽培試験により、長期湛水(CK)、乾湿交替(AWD)、長期浸水+Fe2+(CK+Fe)と乾湿交替+Fe2+(AWD+Fe)の4つの処理下でのイネ根系遺伝子の差異発現スペクトルを研究した。[結果]AWD処理はCK処理と比較して、イネ根系には506個の差次的発現遺伝子(DEG)がアップレギュレーションされ、687個のDEGがダウンレギュレーションされたことが示された。AWD+Fe処理はCK+Fe処理と比較して、308個のDEGのアップレギュレーションと179個のDEGのダウンレギュレーション発現があった。CK+Fe処理はCK処理と比べて、728個のDEGのアップレギュレーションと1175個のDEGのダウンレギュレーション発現があった。AWD+Fe処理はAWD処理と比べて、1252個のDEGのアップレギュレーションと1189個のDEGのダウンレギュレーション発現があった。次元図分析により、全部で3822個のDEGがAWD誘導水稲根の鉄膜形成過程に参与していることが分かった。遺伝子機能(GO)の分析により、生物過程において、270個のDEGが酸化還元反応過程に関与し、分子機能の中で165個のDEGが酸化還元酵素の機能と関係があることが明らかになった。生物学的経路濃縮分析(KEGG)の結果は,AWDが根の鉄膜の形成に関与することを示したが,AWDと根の鉄膜形成過程は38の共有DEGを示した。。 AWDは根の形成に関与していることを示した。これらの遺伝子のタンパク質の注釈は水稲の耐病性、耐乾性、細胞壁と細胞膜、酸化還元、蛋白質キナーゼと輸送、代謝の代謝過程と関係がある。CK処理と比べ、AWD処理は酸化還元反応プロセスに関連する遺伝子が102個に達し、総DEG数の8.25%を占め、AWD処理は水稲根系のペルオキシダーゼ、脂肪酸オキシダーゼ及びエタノール酸化酵素などの関連遺伝子のアップレギュレーションを促進した。CK処理と比較して,AWD処理はイネの根の活力と根の鉄膜の数を増加させ,それぞれ22.9%と45.7%であった。リアルタイム蛍光定量PCRによる検証結果は転写群の分析結果とほぼ一致し、その相関係数は0.90に達した。[結論]以上の結果から,AWDは酸化還元反応における関連遺伝子の大量発現を誘導し,根の酸化力を増加させ,根表面の鉄膜の形成を促進することが明らかになった。過酸化酵素,脂肪酸オキシダーゼ,およびエタノールオキシダーゼなどの関連遺伝子は,AWDによって誘発されたイネ根の鉄膜形成の重要な遺伝子であるかもしれない。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
分類
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稲作 

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