文献

J-GLOBAL ID：201702251379025775   整理番号：17A2005472

核酸塩基とジメチルスルホキシド/水分子における分子間相互作用:DFT,NBO,AIMおよびNCI解析【Powered by NICT】

Intermolecular interaction in nucleobases and dimethyl sulfoxide/water molecules: A DFT, NBO, AIM and NCI analysis

著者 (3件)： Venkataramanan Natarajan Sathiyamoorthy (New Industry Creation Hatchery Center, Tohoku University, 6-6-4 Aramaki-aza-Aoba, Aoba-ku, Sendai 980-8579, Japan) ,  Suvitha Ambigapathy (New Industry Creation Hatchery Center, Tohoku University, 6-6-4 Aramaki-aza-Aoba, Aoba-ku, Sendai 980-8579, Japan) ,  Kawazoe Yoshiyuki (New Industry Creation Hatchery Center, Tohoku University, 6-6-4 Aramaki-aza-Aoba, Aoba-ku, Sendai 980-8579, Japan)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 78  ページ： 48-60  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,核酸塩基間の相互作用と包括的な量子化学アプローチを用いた非従来型CH...O/N H結合を介して起こる水/DMSO分子の物理化学的性質とエネルギー論を明らかにすることを目的とした。計算した相互作用エネルギーは,全ての核酸塩基溶媒錯体の明らかな変化を示し,水和エンタルピーに関する実験的知見を適合していない。水と比較して,DMSOは高い相互作用エネルギーと複合体を形成する。定量的分子静電ポテンシャルを,複合体形成の間の電荷移動を示した。NBO解析は核酸塩基DMSO錯体を示し,核酸塩基水錯体より高い安定化エネルギー値を示した。AIM解析は核酸塩基DMSO錯体における,SO...H-N型相互作用は高いE_HB値と最も強い水素結合強度を有することを示した。さらに,電子密度と全電子密度のLaplace演算子は,これらの系における結合の部分共有結合性を示す陰性であったが,他の結合は非共有相互作用に分類される。EDA解析が示す,静電相互作用が核酸塩基水錯体の場合でより顕著であったが,分散の寄与は核酸塩基DMSO錯体においてより支配的である。NCI RDG解析は核酸塩基DMSO錯体における強い水素結合の存在,AIM結果を支えるを証明した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 水和熱 ,  共有結合 ,  電子密度 ,  *核酸塩基 ,  水素結合 ,  量子化学 ,  電荷移動 ,  複合体 ,  静電相互作用 ,  *分子間相互作用 ,  *水分子 ,  錯体
準シソーラス用語： 安定化エネルギー ,  分子静電ポテンシャル ,  相互作用エネルギー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 核酸塩基 ,  DFT ,  AIM ,  溶剤 ,  非共有結合性相互作用

分類 (2件)： 分子の電子構造  (BH05010Q) ,  分子化合物  (CE02000C)

タイトルに関連する用語 (7件)： 核酸塩基 ,  ジメチルスルホキシド ,  水分子 ,  分子間相互作用 ,  DFT ,  AIM ,  解析