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J-GLOBAL ID：201702251413342124   整理番号：17A1464526

次世代シークエンシングによるカンジダ・グラブラタにおけるエキノカンジン,アゾールおよび5-フルオロシトシンに対する抵抗性の遺伝的マーカーの同定:実現可能性研究【Powered by NICT】

Identification of genetic markers of resistance to echinocandins, azoles and 5-fluorocytosine in Candida glabrata by next-generation sequencing: a feasibility study

著者 (15件)： Biswas C. (Centre for Infectious Diseases and Microbiology Laboratory Services, Westmead Hospital, Sydney, Australia) ,  Biswas C. (Centre for Infectious Diseases and Microbiology-Public Health, Westmead Hospital, Sydney, Australia) ,  Chen S.C.-A. (Centre for Infectious Diseases and Microbiology Laboratory Services, Westmead Hospital, Sydney, Australia) ,  Chen S.C.-A. (Centre for Infectious Diseases and Microbiology-Public Health, Westmead Hospital, Sydney, Australia) ,  Chen S.C.-A. (Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, The University of Sydney, Sydney, Australia) ,  Halliday C. (Centre for Infectious Diseases and Microbiology Laboratory Services, Westmead Hospital, Sydney, Australia) ,  Kennedy K. (Department of Infectious Diseases and Microbiology, Canberra Hospital, Australian National University Medical School, Canberra, Australia) ,  Playford E.G. (Infection Management Services, Princess Alexandra Hospital, Brisbane, Australia) ,  Marriott D.J. (Department of Microbiology and Infectious Diseases, St Vincent’s Hospital, Sydney, Australia) ,  Slavin M.A. (Department of Infectious Diseases, Peter MacCallum Cancer Centre, Melbourne, Australia) ,  Sorrell T.C. (Centre for Infectious Diseases and Microbiology-Public Health, Westmead Hospital, Sydney, Australia) ,  Sorrell T.C. (Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, The University of Sydney, Sydney, Australia) ,  Sintchenko V. (Centre for Infectious Diseases and Microbiology Laboratory Services, Westmead Hospital, Sydney, Australia) ,  Sintchenko V. (Centre for Infectious Diseases and Microbiology-Public Health, Westmead Hospital, Sydney, Australia) ,  Sintchenko V. (Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, The University of Sydney, Sydney, Australia)
資料名： Clinical Microbiology and Infection  (Clinical Microbiology and Infection)
巻： 23  号： 9  ページ： 676.e7-676.e10  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3155A  ISSN： 1198-743X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Candida glabrataにおける多重抗真菌薬耐性菌が増加している。C.glabrataにおける抗真菌薬剤耐性マーカーの存在を調べるために次世代シーケンシング(NGS)の実現可能性を検討した。C.glabrataの12臨床分離菌及び1ATCC株の抗真菌感受性をSensititre YeastOne~YO10アッセイを用いて決定した。これらは各対の二分離株はMIC薬物の上昇を開発した三分離物対を含んでいた。エキノカンジン,アゾールと5-フルオロシトシン抵抗に関連していることが知られている遺伝子の一塩基多型(SNP)はNGSを通して全ての分離株を分析した。FKS1,FKS2,CgCDR1,CgPDR1とFCY2などの抗真菌抵抗性遺伝子における高品質非同義SNPsを同定した。三分離物対の二では,各対から二分離株におけるMICのA>60倍上昇した全てのエキノカンジン一エキノカンジン耐性分離株はFKS1(S629P)と他のFKS2(S663P)における変異を持っていた。第三対のうち,5-フルオロシトシン感受性および耐性分離株の両方がFCY2(A237T)における変異を持っていた。CgPDR1のSNPsはパンアゾール耐性分離株で見られた。アゾール耐性(CgCDR1,ERG9とCgFLR1)に関連した他の遺伝子におけるSNPはアゾール感受性とアゾール耐性両単離株に存在した。SNPもCandidaアドヘシン遺伝子EPA1,EPA6,PWP2とPWP5で同定されたが,それらの存在は,より高い薬物MICと関連しなかった。抗真菌耐性マーカーのゲノムワイド解析は可能であり,同時に異なる抗真菌薬クラスに耐性に関与する遺伝子の変異パターンを明らかにした。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 一塩基多型 ,  Candida ,  感受性 ,  臨床分離菌 ,  *抗真菌薬 ,  遺伝子 ,  単離 ,  真菌類
準シソーラス用語： 同義置換 ,  分離株 ,  抗真菌薬耐性 ,  Candida glabrata ,  *遺伝子マーカ ,  *エキノカンジン ,  *次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 抗真菌抵抗性 ,  Candida glabrata ,  次世代シークエンシング ,  エキノカンジン ,  アゾール ,  一塩基多型

分類 (2件)： 微生物感染の生理と病原性  (EG03053T) ,  抗かび薬の基礎研究  (GW17060K)

タイトルに関連する用語 (8件)： 次世代シークエンシング ,  エキノカンジン ,  アゾール ,  抵抗性 ,  遺伝的マーカー ,  同定 ,  実現可能性 ,  研究