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J-GLOBAL ID：201702252780240905   整理番号：17A1431791

水力tRNAseqとPAR-CLIPによる前駆体および成熟ヒトt RNAの発現とプロセシングの特性化【Powered by NICT】

Characterizing Expression and Processing of Precursor and Mature Human tRNAs by Hydro-tRNAseq and PAR-CLIP

著者 (6件)： Gogakos Tasos (Howard Hughes Medical Institute and Laboratory for RNA Molecular Biology, The Rockefeller University, 1230 York Avenue, Box 186, New York, NY 10065, USA) ,  Brown Miguel (Howard Hughes Medical Institute and Laboratory for RNA Molecular Biology, The Rockefeller University, 1230 York Avenue, Box 186, New York, NY 10065, USA) ,  Garzia Aitor (Howard Hughes Medical Institute and Laboratory for RNA Molecular Biology, The Rockefeller University, 1230 York Avenue, Box 186, New York, NY 10065, USA) ,  Meyer Cindy (Howard Hughes Medical Institute and Laboratory for RNA Molecular Biology, The Rockefeller University, 1230 York Avenue, Box 186, New York, NY 10065, USA) ,  Hafner Markus (Laboratory of Muscle Stem Cells and Gene Regulation, National Institute for Arthritis and Musculoskeletal and Skin Diseases, 50 South Drive, MSC 8024, Bethesda, MD 20892, USA) ,  Tuschl Thomas (Howard Hughes Medical Institute and Laboratory for RNA Molecular Biology, The Rockefeller University, 1230 York Avenue, Box 186, New York, NY 10065, USA)
資料名： Cell Reports  (Cell Reports)
巻： 20  号： 6  ページ： 1463-1475  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3124A  ISSN： 2211-1247  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生物学および疾患の基本的な側面におけるtRNAの関与はtRNA遺伝子の正確で実験的に確認されたアノテーションとt RNA配列のキュレーションを必要とする。RNA二次構造,ヌクレオチド修飾,tRNA遺伝子多様性は配列決定とマッピング努力を複雑にしているので,このことは難しい問題である。これらの問題に取り組むために,筆者らは,水力tRNAseq,配列決定のために適したフラグメントを生成する部分的アルカリ性RNA加水分解に基づく方法を開発した。転写されたtRNA遺伝子を同定するために,著者らはさらにSSB/La,プレt RNAプロセシングに関与する保存された蛋白質の光活性化橋かけと免疫沈降(PAR CLIP)でこの方法を補完した。著者らの結果は,すべての予測t RNA遺伝子の約半分はヒト細胞で転写されることを示した。もヌクレオチド修飾部位と導入の順序を報告し,t RNAリーダー,トレーラ,とイントロンを同定した。相補的配列決定法を用いて,ヒトt RNAアトラスを提示し,ヒト細胞におけるtRNAの成熟とプロセシング中間体の発現レベルを決定した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *前駆体 ,  タンパク質 ,  *tRNA ,  遺伝子 ,  ヌクレオチド ,  *ヒト ,  中間体 ,  加水分解 ,  *RNA【核酸】 ,  免疫沈降反応 ,  アノテーション ,  イントロン ,  *キャラクタリゼーション ,  予測
準シソーラス用語： tRNA遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (10件)： 水力 ,  PAR ,  CLIP ,  前駆体 ,  成熟 ,  ヒト ,  RNA ,  発現 ,  プロセシング ,  特性化