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J-GLOBAL ID：201702252971277149   整理番号：17A0879175

単一バリアントレベルでの炎症性腸疾患関連座位の精細マッピング

Fine-mapping inflammatory bowel disease loci to single-variant resolution

著者 (63件)： HUANG Hailiang (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  FARH Kyle Kai-How (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  DALY Mark J. (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  HUANG Hailiang (Broad Inst., MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  FARH Kyle Kai-How (Broad Inst., MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  XAVIER Ramnik J. (Broad Inst., MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  DALY Mark J. (Broad Inst., MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  FANG Ming (Univ. Liege, Liege, BEL) ,  CRINS Francois (Univ. Liege, Liege, BEL) ,  DEFFONTAINE Valerie (Univ. Liege, Liege, BEL) ,  DMITRIEVA Julia (Univ. Liege, Liege, BEL) ,  DOCAMPO Elisa (Univ. Liege, Liege, BEL) ,  ELANSARY Mahmoud (Univ. Liege, Liege, BEL) ,  GORI Ann-Stephan (Univ. Liege, Liege, BEL) ,  LOUIS Edouard (Univ. Liege, Liege, BEL) ,  MARIMAN Rob (Univ. Liege, Liege, BEL) ,  MNI Myriam (Univ. Liege, Liege, BEL) ,  MOMOZAWA Yukihide (Univ. Liege, Liege, BEL) ,  THEATRE Emilie (Univ. Liege, Liege, BEL) ,  GEORGES Michel (Univ. Liege, Liege, BEL) ,  JOSTINS Luke (Univ. Oxford, Headington, GBR) ,  JOSTINS Luke (Univ. Oxford, St Aldates, GBR) ,  CORTES Adrian (Univ. Oxford, Headington, GBR) ,  MIRKOV Masa Umicevic (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridgeshire, GBR) ,  ANDERSON Carl A. (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridgeshire, GBR) ,  SPAIN Sarah L. (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridgeshire, GBR) ,  TRYNKA Gosia (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridgeshire, GBR) ,  BARRETT Jeffrey C. (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridgeshire, GBR) ,  BOUCHER Gabrielle (Montreal Heart Inst., Queabec, CAN) ,  GOYETTE Philippe (Montreal Heart Inst., Queabec, CAN) ,  RIOUX John D. (Montreal Heart Inst., Queabec, CAN) ,  ANDERSEN Vibeke (Hospital of Southern Jutland, Abenra, DNK) ,  ANDERSEN Vibeke (Univ. Southern Denmark, Odense, DNK) ,  CLEYNEN Isabelle (KU Leuven, Leuven, BEL) ,  VERMEIRE Severine (KU Leuven, Leuven, BEL) ,  CORTES Adrian (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  D’AMATO Mauro (Karolinska Institutet, Stockholm, SWE) ,  D’AMATO Mauro (BioDonostia Health Res. Inst., San Sebastian, ESP) ,  D’AMATO Mauro (Basque Foundation for Sci., Bilbao, ESP) ,  FARH Kyle Kai-How (Illumina, California, USA) ,  FRANKE Andre (Christian-Albrechts-Univ. Kiel, Kiel, DEU) ,  HALFVARSON Jonas (OErebro Univ., OErebro, SWE) ,  HARITUNIANS Talin (Cedars-Sinai Medical Center, California, USA) ,  MCGOVERN Dermot P. B. (Cedars-Sinai Medical Center, California, USA) ,  KNIGHT Jo (Lancaster Univ., Lancaster, GBR) ,  LAWRANCE Ian C. (Saint John of God Hospital, Western Australia, AUS) ,  LAWRANCE Ian C. (Univ. Western Australia, Western Australia, AUS) ,  LEES Charlie W. (Western General Hospital Univ. Edinburgh, Edinburgh, GBR) ,  SATSANGI Jack (Western General Hospital Univ. Edinburgh, Edinburgh, GBR) ,  MEUWISSEN Theo (Norwegian Univ. Life Sci., As, NOR) ,  MOMOZAWA Yukihide (RIKEN, Kanagawa, JPN) ,  PARKES Miles (Addenbrooke’s Hospital, Cambridge, GBR) ,  SPAIN Sarah L. (Wellcome Trust Genome Campus, Cambridgeshire, GBR) ,  VAN SOMMEREN Suzanne (Univ. Groningen and Univ. Medical Center Groningen, Groningen, NLD) ,  WEERSMA Rinse K. (Univ. Groningen and Univ. Medical Center Groningen, Groningen, NLD) ,  VERMEIRE Severine (Univ. Hospital Gasthuisberg, Leuven, BEL) ,  XAVIER Ramnik J. (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  DUERR Richard H. (Univ. Pittsburgh School of Medicine, Pennsylvania, USA) ,  DUERR Richard H. (Univ. Pittsburgh Graduate School of Public Health, Pennsylvania, USA) ,  MATHEW Christopher G. (King’s Coll. London, London, GBR) ,  MATHEW Christopher G. (Univ. the Witwatersrand, Johannesburg, ZAF) ,  RIOUX John D. (Univ.a de Montreaal, Queabec, CAN) ,  CHO Judy H. (Yale School of Medicine, Connecticut, USA)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 547  号： 7662  ページ： 173-178  発行年： 2017年07月13日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 炎症性腸疾患は,世界で数百万人が罹患する消化管の慢性炎症性疾患である。ゲノム規模関連研究により200の炎症性腸疾患関連座位が明らかになっているが,最終的に特定の機能バリアントまで明らかにされた座位はほとんどない。今回我々は,6万7852人を対象に高密度に遺伝子型を決定した94の炎症性腸疾患関連座位について精細マッピングを行った。そのうち18座位で95%以上,27座位で50%以上の確実性で単一の原因バリアントが見つかった。これら45のバリアントは,タンパク質翻訳領域(n= 13),転写因子結合部位に直接的に影響する領域(n= 3),エピジェネティックな変化に組織特異性がある領域(n= 10)に有意に多く見られた。また,クローン病と強い関連を示すバリアントでは特定の免疫細胞に,逆に潰瘍性大腸炎と強い関連を示すバリアントでは腸粘膜においてその組織特異性が強く認められた。本研究の成果は,大規模試料を用いた高分解能の精細マッピングにより,ゲノム規模関連研究から得られた多くの関連座位から統計的に確かな原因バリアントの特定が可能なことを示唆しており,疾患発症メカニズムの実験的な解明のための強力な基盤となる。Copyright Nature Japan KK 2018

シソーラス用語： *炎症 ,  *腸疾患 ,  *ゲノムワイド関連解析 ,  ヒト ,  生体試料 ,  *腸粘膜 ,  *細胞 ,  Crohn病 ,  *遺伝子多型 ,  遺伝子 ,  DNA結合タンパク質 ,  アダプタータンパク質 ,  リンタンパク質 ,  転写因子
準シソーラス用語： *炎症性腸疾患 ,  *免疫細胞 ,  原因遺伝子 ,  Smad3

分類 (2件)： 集団遺伝学  (EC01040J) ,  免疫性疾患・アレルギー性疾患一般  (GD04010C)

タイトルに関連する用語 (4件)： バリアント ,  炎症性腸疾患 ,  座位 ,  精細マッピング