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J-GLOBAL ID：201702253450614732   整理番号：17A0835768

MetaboSignal 代謝経路およびシグナル伝達経路を介したメタボリックタイプの調節のトポロジー分析のためのネットワークベースの手法

MetaboSignal: a network-based approach for topological analysis of metabotype regulation via metabolic and signaling pathways

著者 (8件)： RODRIGUEZ-MARTINEZ Andrea (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  AYALA Rafael (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  POSMA Joram M. (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  NEVES Ana L. (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  GAUGUIER Dominique (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  GAUGUIER Dominique (INSERM, Paris, FRA) ,  NICHOLSON Jeremy K. (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  DUMAS Marc-Emmanuel (Imperial Coll. London, London, GBR)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 5  ページ： 773-775  発行年： 2017年03月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 代謝経路とシグナル伝達経路を統合するための汎用性の高いRパッケージMetaboSignalについて示した。MetaboSignalでは,ネットワークトポロジー解析に基づいてシグナル伝達関連遺伝子および代謝関連遺伝子と代謝物の関係を可視化し,代謝表現型の遺伝的背景を調べることが可能である。また,MetaboSignalには他の経路データベースや相互作用を取り込むこともできる。MetaboSignalはBioconductorから入手可能である。

シソーラス用語： プログラミング言語 ,  プログラムパッケージ ,  生物学 ,  *代謝経路 ,  細胞情報伝達 ,  位相幾何学 ,  ネットワーク ,  *遺伝子 ,  遺伝
準シソーラス用語： *MetaboSignal ,  Rパッケージ ,  *シグナル伝達経路 ,  システム生物学 ,  *トポロジー ,  遺伝的背景

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (7件)： 代謝経路 ,  シグナル伝達経路 ,  タイプ ,  調節 ,  トポロジー ,  分析 ,  手法