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J-GLOBAL ID：201702253778358659   整理番号：17A1022838

β-グルカンの効果とデクチン-1受容体の構造へのその潜在的類似体【Powered by NICT】

The effect of β-glucan and its potential analog on the structure of Dectin-1 receptor

著者 (4件)： Chaturvedi Navaneet (Department of Biochemistry and Molecular Biology, George S. Wise Faculty of Life Sciences, Tel Aviv University, Tel Aviv, Israel) ,  Yadav Brijesh Singh (Department of Molecular Biology and Ecology of Plants, Tel Aviv University, Tel Aviv, Israel) ,  Pandey Paras Nath (Deparment of Mathematics, University of Allahabad, India) ,  Tripathi Vijay (Institute of Soil, Water, Environmental Sciences, Agricultural Research Organization, Volcani Center, Bet Dagan, Israel)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 74  ページ： 315-325  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： デクチン-1は抗真菌自然免疫,β-グルカン(BG)に特異的な受容体に作用する重要な役割を果たしていることを最近発見されたパターン認識受容体である。本研究はデクチン-1受容体に対するBGの効果と新しい類似体,マルトトリオース(MT)を明らかにすることを目的とした。模型に依存しない全原子分子動力学シミュレーションと共にデクチン-1に対するMTの分子ドッキングを実施した。シミュレーションは,三レベルの複雑性で行った。(1)アポデクチン1,(2)BG:デクチン-1(3)MT:デクチン-1。全て三系錯体を比較分析を示す前に安定性チェックを行った。MT:デクチン-1で記録されたが,特徴は,MTの原子に対するループ(loop1とループ2)配向のシフトであり,広い相互作用は,BG:デクチン-1との比較上のロバストな強束縛を示唆した。自由エネルギー推定は,観察,さらに,相互作用残基のエネルギー成分の寄与を明らかにすることにより近い一致を確認した。さらに,錯体のクラスタ分析は,新しい確認に滑らかな連続転移を示し,より長い寿命をもつ各クラスタの系列により表現される。主成分分析は原子の運動中のBG:デクチン-1の結合部位での破れた管を明らかにしたMTが:デクチン-1は軌道中の原子の広いバンドと高振幅運動を示し,たに対するループ配向に起因する。観測は,距離測定と水素結合計算により示された。BGのシミュレーション:デクチン-1及びMT:デクチン-1複合体は,BGとMT配位子の影響を初めて明らかにした。デクチン-1に対するBGとMT相互作用の知識を拡げる可能性があるとの更なる可能性バイオアッセイを提案した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 主成分分析 ,  結合部位 ,  相互作用 ,  モデル ,  複合体 ,  クラスタ分析 ,  真菌類 ,  計算機シミュレーション ,  ロバスト性 ,  *受容体 ,  バイオアッセイ ,  クラスタ ,  モデリング ,  水素結合
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  分子ドッキング ,  *クチン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： KeyWordデクチン-1 ,  β-グルカン ,  分子動力学シミュレーション ,  分子ドッキング ,  原理成分分析 ,  ループシフトモデル

分類 (2件)： 分子化合物  (CE02000C) ,  細胞膜の受容体  (EF04030C)

タイトルに関連する用語 (4件)： β-グルカン ,  デクチン-1 ,  受容体 ,  類似体