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J-GLOBAL ID：201702254740843551   整理番号：17A1551037

小分子安定剤のための新たな標的としての過渡的ポケットを利用するための一般化された計算機ワークフローに向けて:まれな疾患アルカプトン尿症の基底におけるホモゲンチジン酸1,2 ジオキシゲナーゼ変異株への応用【Powered by NICT】

Toward a generalized computational workflow for exploiting transient pockets as new targets for small molecule stabilizers: Application to the homogentisate 1,2-dioxygenase mutants at the base of rare disease Alkaptonuria

著者 (7件)： Bernini Andrea (Department of Biotechnology, Chemistry and Pharmacy, University of Siena, via Aldo Moro 2, 53100 Siena, Italy) ,  Galderisi Silvia (Department of Biotechnology, Chemistry and Pharmacy, University of Siena, via Aldo Moro 2, 53100 Siena, Italy) ,  Spiga Ottavia (Department of Biotechnology, Chemistry and Pharmacy, University of Siena, via Aldo Moro 2, 53100 Siena, Italy) ,  Bernardini Giulia (Department of Biotechnology, Chemistry and Pharmacy, University of Siena, via Aldo Moro 2, 53100 Siena, Italy) ,  Niccolai Neri (Department of Biotechnology, Chemistry and Pharmacy, University of Siena, via Aldo Moro 2, 53100 Siena, Italy) ,  Manetti Fabrizio (Department of Biotechnology, Chemistry and Pharmacy, University of Siena, via Aldo Moro 2, 53100 Siena, Italy) ,  Santucci Annalisa (Department of Biotechnology, Chemistry and Pharmacy, University of Siena, via Aldo Moro 2, 53100 Siena, Italy)
資料名： Computational Biology and Chemistry  (Computational Biology and Chemistry)
巻： 70  ページ： 133-141  発行年： 2017年 
JST資料番号： H0201B  ISSN： 1476-9271  CODEN： COCHDK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ホモゲンチジン酸1,2 ジオキシゲナーゼ(HGD)遺伝子の変異は,組織におけるその蓄積は組織褐変症と変性を引き起こすホモゲンチジン酸(HGA)の酵素的分解のそれに引き続く損失と共に有害または誤って折り畳まれた生成物に導くアルカプトン尿症(AKU)は,代謝の先天異常である。AKUの認可された治療ではない。多くのミスセンス変異は天然六量体HGDの四次構造破壊の原因として個別化した。AKUの治療への新しいアプローチは,薬理学的シャペロン,すなわち小分子構造安定性を助けるとHGDの標的化による酵素活性を救済完全または部分的に提案した。オリゴマ蛋白質の補因子ポケットは既にそのような戦略の標的として利用することに成功したが,同様の部位はHGD表面で存在しない,過渡ポケットは,薬理学的シャペロンの標的として提案されている。過渡ポケットは蛋白質の分子動力学トラジェクトリーに沿って検出され,生化学的および薬理学的基準の平均による構造安定化に適した地点の集合までフィルタリングした。結果はオリゴマ,誤って折畳まれた酵素の救助を必要とする代謝の他の先天異常に関連する計算ワークフローである。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： オリゴマ ,  四次構造 ,  *ジオキシゲナーゼ ,  *ワークフロー ,  遺伝子 ,  *小分子 ,  生化学 ,  ターゲティング ,  薬理学 ,  酵素活性度 ,  分子動力学 ,  シャペロンタンパク質 ,  酵素的分解
準シソーラス用語： 先天異常 ,  *アルカプトン尿症 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： 薬理学的シャペロン ,  過渡ポケット ,  ホモゲンチジン酸12 ジオキシゲナーゼ

分類 (4件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  生物学的機能  (EB03040U) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (12件)： 小分子 ,  安定剤 ,  標的 ,  計算機 ,  ワークフロー ,  疾患 ,  アルカプトン尿症 ,  基底 ,  ホモゲンチジン酸 ,  ジオキシゲナーゼ ,  変異株 ,  応用