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J-GLOBAL ID：201702254833934992   整理番号：17A0908003

複製された常在菌叢ゲノム配列決定試料を用いた分類学的または機能的均一性の簡単な統計的検定【Powered by NICT】

A simple statistical test of taxonomic or functional homogeneity using replicated microbiome sequencing samples

著者 (8件)： Huson Daniel H. (Center for Bioinformatics, University of Tuebingen, Germany) ,  Steel Mike (Biomathematics Research Centre, University of Canterbury, Christchurch, New Zealand) ,  El-Hadidi Mohamed (Center for Bioinformatics, University of Tuebingen, Germany) ,  Mitra Suparna (Faculty of Medicine and Health - University of Leeds, Old Medical School, Leeds General Infirmary, Leeds, UK) ,  Peter Silke (Institute of Medical Microbiology and Hygiene, University of Tuebingen, Germany) ,  Peter Silke (German Center for Infection Research (DZIF), Partner Site Tuebingen, Germany) ,  Willmann Matthias (Institute of Medical Microbiology and Hygiene, University of Tuebingen, Germany) ,  Willmann Matthias (German Center for Infection Research (DZIF), Partner Site Tuebingen, Germany)
資料名： Journal of Biotechnology  (Journal of Biotechnology)
巻： 250  ページ： 45-50  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0456C  ISSN： 0168-1656  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ミクロビオーム解析における一つの重要な問題は,与えられた環境における微生物組成の均一性を評価するために,所定の分析法に関してするかということである。同じ環境生物の同じ分類学的分布に従うから採取した異なる微生物試料,または機能の同じ分布を我々はこの種の問題を解決するために非パラメトリック統計的「三角測量試験」を提供する”これから”。試験は,複数の複製は生物学的試料のそれぞれで使用可能なことを必要とし,試料の三方向計算比較に基づいている。試験の適用を説明するために,ヒト糞便のワンピースの異なる場所から採取した三種の生物学的試料,各三回反復により表現を収集し,MEGANを用いてそれらを分析した。(その名前にもかかわらず,三角測量試験は,生体試料または反復の数は三であることを必要としない。)三角形分割試験を三種類の生物学的試料は,分類群または機能(誤り率≦0.05)の同じ分布を示し,調べたヒト糞便の微生物組成は,巨視的スケールで均一でないことを示しているという帰無仮説をリジェクト,複数位置からの材料プーリングは,合理的な方法であることを示唆した。オープンソースプログラムMEGAN地域版における試験の実施を提供した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： ヒト ,  微生物 ,  三角形分割 ,  三角測量 ,  *生体試料 ,  誤り率
準シソーラス用語： 帰無仮説 ,  分類群 ,  *統計的検定 ,  *分類学 ,  *常在菌叢ゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： メタゲノミクス ,  分類学的組成 ,  機能的多様性 ,  環境不均一性 ,  統計的試験

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物の生態  (EG03040J)

タイトルに関連する用語 (6件)： 複製 ,  常在菌 ,  ゲノム配列 ,  試料 ,  均一性 ,  統計的検定