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J-GLOBAL ID：201702255812887064   整理番号：17A0618393

免疫:Immunosequencingからサイトメガロウイルス曝露歴とHLAがT細胞レパートリーに及ぼす影響のシグネチャーが明らかになる

Immunosequencing identifies signatures of cytomegalovirus exposure history and HLA-mediated effects on the T cell repertoire

著者 (14件)： EMERSON Ryan O (Adaptive Biotechnologies, Washington, USA) ,  DEWITT William S (Adaptive Biotechnologies, Washington, USA) ,  VIGNALI Marissa (Adaptive Biotechnologies, Washington, USA) ,  HU Joyce K (Adaptive Biotechnologies, Washington, USA) ,  OSBORNE Edward J (Adaptive Biotechnologies, Washington, USA) ,  DESMARAIS Cindy (Adaptive Biotechnologies, Washington, USA) ,  KLINGER Mark (Adaptive Biotechnologies, Washington, USA) ,  RIEDER Mark (Adaptive Biotechnologies, Washington, USA) ,  ROBINS Harlan S (Adaptive Biotechnologies, Washington, USA) ,  DEWITT William S (Fred Hutchinson Cancer Res. Center, Washington, USA) ,  ROBINS Harlan S (Fred Hutchinson Cancer Res. Center, Washington, USA) ,  GRAVLEY Jenna (Fred Hutchinson Cancer Res. Center, Washington, USA) ,  CARLSON Christopher S (Fred Hutchinson Cancer Res. Center, Washington, USA) ,  HANSEN John A (Fred Hutchinson Cancer Res. Center, Washington, USA)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 49  号： 5  ページ： 659-665  発行年： 2017年05月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ある人のT細胞レパートリーには,病原体への曝露歴の変化がコードされている。パブリック(多数の人に共有される遺伝子配列の)T細胞受容体(TCR)を確認することにより,病原体への曝露シグネチャーを同定できるのではないだろうか。それを検証するため,血清中のサイトメガロウイルス(CMV)抗体の有無が既知である666人について,immunosequencing(免疫系遺伝子の塩基配列決定)によってT細胞レパートリーのプロファイリングを行った。我々は,統計学を用いた分類方法を開発し,得られたTCRβ塩基配列のカタログから,最初のコホートおよび120人からなる検証コホートの両方において,高い特異性と感受性でCMV抗体の有無を診断することができた。また,同定されたCMV関連TCRβ分子のうちの3つがin vitroでCMVに結合することも確認した。さらに,この手法を用いて最初のコホートの大部分の人のHLA-AおよびHLA-Bの対立遺伝子を正確に予測することができた。我々の手法は高度に並列化できる診断戦略であり,全ての記憶T細胞応答は体細胞TCR組換えという共通の形式にコードされるので,他の免疫学的表現型にも,さまざまな疾患状態にも一般化できる可能性がある。Copyright Nature Japan KK 2017

シソーラス用語： ヒト ,  血清 ,  サイトメガロウイルス ,  *ウイルス感染 ,  *T細胞 ,  抗体 ,  *遺伝子 ,  ヌクレオチド配列 ,  遺伝学実験技術 ,  T細胞受容体 ,  HLA-A ,  HLA-B ,  分類 ,  統計学 ,  コホート研究 ,  診断
準シソーラス用語： TCRβ鎖 ,  イムノシークエンシング ,  細胞分類 ,  *免疫系遺伝子

分類 (4件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  免疫反応一般  (ED03010T) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  基礎診断学  (GC03002P)

タイトルに関連する用語 (6件)： 免疫 ,  サイトメガロウイルス ,  曝露 ,  HLA ,  T細胞 ,  シグネチャー