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J-GLOBAL ID：201702256006142679   整理番号：17A1464040

539高度情報遺伝子座の系統ゲノミクス分析は生きているカメ(カメ目)の主要分岐群のための完全時間分解ツリーをdates【Powered by NICT】

Phylogenomic analyses of 539 highly informative loci dates a fully resolved time tree for the major clades of living turtles (Testudines)

著者 (6件)： Shaffer H. Bradley (Department of Ecology and Evolutionary Biology, La Kretz Center for California Conservation Science, and Institute of the Environment and Sustainability, University of California, Los Angeles, CA 90095, USA) ,  McCartney-Melstad Evan (Department of Ecology and Evolutionary Biology, La Kretz Center for California Conservation Science, and Institute of the Environment and Sustainability, University of California, Los Angeles, CA 90095, USA) ,  Near Thomas J. (Department of Ecology and Evolutionary Biology, Yale University, New Haven, CT 06520, USA) ,  Mount Genevieve G. (Department of Ecology and Evolutionary Biology, La Kretz Center for California Conservation Science, and Institute of the Environment and Sustainability, University of California, Los Angeles, CA 90095, USA) ,  Mount Genevieve G. (Department of Biological Sciences, Museum of Natural Science, 119 Foster Hall, Louisiana State University, Baton Rouge, LA 70803, USA) ,  Spinks Phillip Q. (Department of Ecology and Evolutionary Biology, La Kretz Center for California Conservation Science, and Institute of the Environment and Sustainability, University of California, Los Angeles, CA 90095, USA)
資料名： Molecular Phylogenetics and Evolution  (Molecular Phylogenetics and Evolution)
巻： 115  ページ： 7-15  発行年： 2017年 
JST資料番号： W1678A  ISSN： 1055-7903  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 正確な時間を調整された系統発生は,多くの大進化研究の最重要項目である,分子データセットのサイズとスケールと化石較正の密度と精度の間の関係は時間木研究の重要な要素である。ここでは,特異的に生きているカメの標的捕獲アレイを開発し,超保存要素(UCE)データセットへの効率を比較し,生きているカメ多様性と外集団の幅を代表する26種から配列決定された539核遺伝子座に基づく時間較正した分子系統発生を示した。三完全に配列決定されたカメゲノムに基づく,著者らの遺伝子アレイは13種の同一サブセットの最近発表されたUCEデータよりもカメでより可変2.4倍であり,分類群特異的アレイは,UCEsより配列決定努力当たりより多くの情報データを返すことを確認した。ゲノムデータを用いたクラウンカメの後期三畳紀起源とその姉妹群,祖竜からカメの中期石炭紀の分割を含む生カメクレードの年代を推定した。最古の潜在的な樹冠カメ化石のいくつかを除くと後期ジュラ紀(オックスフォーディアン,163.5 157.3Ma)から明確なクラウン系統Caribemys oxfordiensis化石較正点の年齢を制限する特異的ににより,生きているカメの相対的に古い年代を確証した。も単一種よりも,いくつかの家族内クレードを含む十カメ科五のための新しい年代推定を提供した。クラウンカメの多様性の大部分は,古第三紀に,白亜紀-古第三紀大量絶滅66mya後にように思われた。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 白亜紀 ,  樹冠 ,  カメ科 ,  化石 ,  *系統発生 ,  古第三紀 ,  石炭紀
準シソーラス用語： 大量絶滅 ,  クレード ,  ジュラ紀後期 ,  分類群 ,  分子系統発生 ,  分子データ ,  大進化 ,  *ゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 発散時間推定 ,  系統ゲノミクス分析 ,  カメ ,  化石較正 ,  時間木

分類 (1件)： 進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (9件)： 高度 ,  遺伝子座 ,  系統 ,  ゲノミクス ,  分析 ,  カメ ,  カメ目 ,  分岐 ,  分解