多様化を受けているベゴモウイルスベータサテライト複合体のための分子診断の開発事例研究【Powered by NICT】

Brown Judith K.; Ur-Rehman Muhammad Zia; Avelar Sofia; Chingandu N.; Hameed Usman; Haider Saleem; Ilyas Muhammad

文献

J-GLOBAL ID：201702256172776752 整理番号：17A1707921

多様化を受けているベゴモウイルスベータサテライト複合体のための分子診断の開発事例研究【Powered by NICT】

Molecular diagnostic development for begomovirus-betasatellite complexes undergoing diversification: A case study

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巻： 241 ページ： 29-41 発行年： 2017年
JST資料番号： A0381D ISSN： 0168-1702 CODEN： VIREDF 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

綿の葉巻病の原因となる少なくとも五種のベゴモウイルス種はアジアとアフリカにおける最近出現した,繊維品質と収率を低下させた。世界中の他の綿野菜栽培領域にこれらのウイルスの普及の可能性がある広範なルーチン,leaf curlウイルスの代替宿主,特に観賞植物の地球規模輸送によるものであった。ここで報告した研究は,インド亜大陸における二つの最も有力な葉巻関連ベゴモウイルスベータサテライト複合体の分子検出とアフリカ,ワタ葉巻KokhranウイルスBurewala歪とワタ葉巻Geziraウイルス,アジアとアフリカに固有のを促進しポリメラーゼ連鎖反応(PCR)プライマーの設計と検証について述べた。これらベゴモウイルス衛星錯体の進行中のゲノム多様性はヌクレオチド配列アラインメント,及び一塩基多型の分析,プライマー設計のための新しい挑戦を作り出していることが両因子に基づく明白であった。ベータサテライト特異的プライマー設計,種および株特異的に対する付加的な要件は,「コアleaf curl virus複合体」における現存近縁種と株の大きな数のためにプライマー設計と検証に関する更なる制約を課し,現在比較的高度に保存されたコードおよび非コード領域,プライマー「標的」の選択の際に,ゲノムベータサテライト配列の多くを排除を持つことを南アジア,太平洋地域,アフリカアラビア半島における拡大した分布を示した。,PCRプライマーは,代表的な「コアleaf curl’株と選択された植物種から単離した種,遠い親戚,および全DNAのクローン化ウイルスゲノムとベータサテライトの検出のために設計された,その妥当性を確認することに成功した。流入のポートからの輸出または放出前に植物輸入をスクリーニングする分子診断の適用は,綿と同様に野菜と観賞作物宿主の産生を劇的に影響できることを外来leaf curlウイルス導入の可能性を大いに抑えることが期待される。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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ウイルス学一般 , ウイルスによる植物病害

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