文献

J-GLOBAL ID：201702256413166981   整理番号：17A1440546

マツ実生組織の遺伝子発現の全体像【Powered by NICT】

The gene expression landscape of pine seedling tissues

著者 (14件)： Canas Rafael A. (Departamento de Biologia Molecular y Bioquimica, Facultad de Ciencias, Universidad de Malaga, Campus Universitario de Teatinos s/n, 29071, Malaga, Spain) ,  Li Zhen (Department of Plant Biotechnology and Bioinformatics, Ghent University, Technologiepark 927, B-9052, Ghent, Belgium) ,  Li Zhen (Center for Plant Systems Biology, VIB, B-9052, Ghent, Belgium) ,  Li Zhen (Bioinformatics Institute Ghent, Ghent University, Technologiepark 927, B-9052, Ghent, Belgium) ,  Pascual M. Belen (Departamento de Biologia Molecular y Bioquimica, Facultad de Ciencias, Universidad de Malaga, Campus Universitario de Teatinos s/n, 29071, Malaga, Spain) ,  Castro-Rodriguez Vanessa (Departamento de Biologia Molecular y Bioquimica, Facultad de Ciencias, Universidad de Malaga, Campus Universitario de Teatinos s/n, 29071, Malaga, Spain) ,  Avila Concepcion (Departamento de Biologia Molecular y Bioquimica, Facultad de Ciencias, Universidad de Malaga, Campus Universitario de Teatinos s/n, 29071, Malaga, Spain) ,  Sterck Lieven (Department of Plant Biotechnology and Bioinformatics, Ghent University, Technologiepark 927, B-9052, Ghent, Belgium) ,  Sterck Lieven (Center for Plant Systems Biology, VIB, B-9052, Ghent, Belgium) ,  Sterck Lieven (Bioinformatics Institute Ghent, Ghent University, Technologiepark 927, B-9052, Ghent, Belgium) ,  Van de Peer Yves (Department of Plant Biotechnology and Bioinformatics, Ghent University, Technologiepark 927, B-9052, Ghent, Belgium) ,  Van de Peer Yves (Center for Plant Systems Biology, VIB, B-9052, Ghent, Belgium) ,  Van de Peer Yves (Bioinformatics Institute Ghent, Ghent University, Technologiepark 927, B-9052, Ghent, Belgium) ,  Canovas Francisco M. (Departamento de Biologia Molecular y Bioquimica, Facultad de Ciencias, Universidad de Malaga, Campus Universitario de Teatinos s/n, 29071, Malaga, Spain)
資料名： Plant Journal  (Plant Journal)
巻： 91  号： 6  ページ： 1064-1087  発行年： 2017年 
JST資料番号： A1374A  ISSN： 0960-7412  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 針葉樹は北半球の大領域を支配した。木材産業の原料の主な源として,広範囲の生体材料である。古典的植物生物学研究のための実験モデルとしての固有の困難にもかかわらず,ゲノム研究における技術的進歩はこれらの植物に関する基礎的研究を可能にした。レーザーキャプチャーマイクロダイセクションとそれに続くトランスクリプトーム解析の使用は針葉樹組織と特殊化した細胞の分子的および機能的組織化を解明するための強力なツールである。本研究では,1か月齢フランスカイガンショウ(Pinus pinaster)実生からの14種の異なる組織を分離し,それらのトランスクリプトームを解析した。結果は以前の基準トランスクリプトームからの完全長転写物の配列情報と数を増加させ,39841種の新規転写物を加えた。全体で2376の転写物は調べた全ての組織で普遍的に発現した。これらの転写物は,マツのコア「ハウスキーピング遺伝子」を考えることができた。遺伝子はそれらの発現プロファイルと機能的にクラスター化した。この解析は,プロファイルの数を減少させた38では,他の組織よりもはるかに高いことを特異な組織におけるそれらの発現によって定義されたこれらの最も大きい。発現と局在データはConGenIE.org(http://v22.popgenie.org/microdisection/)でアクセス可能である。本研究は,種々のマツの組織中の遺伝子発現分布の概要を示し,組織遺伝子発現と機能の間の関係を強調した。トランスクリプトームアトラスは針葉樹における機能的ゲノミクス研究のための貴重な資源である。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 針葉樹 ,  トランスクリプトーム ,  北半球 ,  クラスタ化 ,  *実生 ,  データベース ,  ハウスキーピング遺伝子 ,  木材工業 ,  *遺伝子発現 ,  *遺伝子
準シソーラス用語： 遺伝子発現プロファイリング ,  Pinus pinaster ,  トランスクリプトーム解析 ,  ゲノミクス ,  生体材料 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： Pinus pinaster ,  針葉樹 ,  種苗 ,  microdissection ,  遺伝子発現 ,  データベース ,  長末端反復配列 ,  Myb ,  窒素代謝

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物生理学一般  (EH02010Y)

タイトルに関連する用語 (4件)： マツ ,  実生 ,  組織 ,  遺伝子発現